More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3395 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 280 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  74.55 
 
 		 279 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  73.19 
 
 		 277 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  73.19 
 
 		 277 aa  428  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  73.19 
 
 		 277 aa  430  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  73.19 
 
 		 277 aa  426  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  68.84 
 
 		 277 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  69.2 
 
 		 277 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  69.57 
 
 		 284 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  69.2 
 
 		 277 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  68.48 
 
 		 277 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  65.95 
 
 		 279 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  66.91 
 
 		 282 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  66.67 
 
 		 280 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  66.3 
 
 		 287 aa  392  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  62.18 
 
 		 277 aa  356  2.9999999999999997e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  59.71 
 
 		 282 aa  343  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  57.72 
 
 		 282 aa  338  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  58.46 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  58.46 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  58.46 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  58.46 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  58.46 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  58.46 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  58.46 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  58.46 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  58.67 
 
 		 277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  58.09 
 
 		 282 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  61.98 
 
 		 274 aa  335  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  58.67 
 
 		 278 aa  332  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  58.49 
 
 		 277 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  58.49 
 
 		 277 aa  332  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  58.09 
 
 		 282 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  58.09 
 
 		 282 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  58.09 
 
 		 282 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  58.09 
 
 		 282 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  56.46 
 
 		 276 aa  331  8e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  58.49 
 
 		 277 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  56.25 
 
 		 277 aa  329  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  58.09 
 
 		 277 aa  329  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  57.35 
 
 		 277 aa  328  4e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  57.72 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  60.23 
 
 		 286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  58.71 
 
 		 277 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  56.81 
 
 		 259 aa  326  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  54.78 
 
 		 277 aa  325  5e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  55.35 
 
 		 279 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  53.7 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  57.03 
 
 		 278 aa  300  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  55.22 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  56.02 
 
 		 283 aa  299  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  51.47 
 
 		 288 aa  298  8e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  55.81 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  54.65 
 
 		 283 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  54.89 
 
 		 283 aa  295  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  58.33 
 
 		 290 aa  293  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  55.43 
 
 		 283 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  54.51 
 
 		 276 aa  291  7e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  52.99 
 
 		 286 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  55.02 
 
 		 283 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  53.68 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  54.65 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  53.41 
 
 		 290 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  55.02 
 
 		 283 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  59.45 
 
 		 286 aa  285  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  53.99 
 
 		 301 aa  282  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  54.58 
 
 		 298 aa  281  9e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  55.06 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  54.01 
 
 		 298 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2900  dihydropteroate synthase  51.92 
 
 		 277 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42870  dihydropteroate synthase  55.26 
 
 		 282 aa  275  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.307408  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  56.72 
 
 		 278 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 		 277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  51.76 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  51.76 
 
 		 264 aa  267  2e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  51.99 
 
 		 299 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  53.28 
 
 		 298 aa  261  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1974  dihydropteroate synthase  57.03 
 
 		 298 aa  260  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490177 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  53.23 
 
 		 277 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  52.24 
 
 		 281 aa  257  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 275 aa  256  4e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  47.64 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  50 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  53.36 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  53.75 
 
 		 258 aa  252  4.0000000000000004e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 		 296 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 280 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 		 296 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 		 296 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 		 296 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 		 296 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 		 296 aa  251  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  51.53 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1969  dihydropteroate synthase  47.86 
 
 		 285 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000758372  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 		 298 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  48.53 
 
 		 394 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  48.08 
 
 		 394 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  48.06 
 
 		 265 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>