More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0111 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  100 
 
 
356 aa  721    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  48.32 
 
 
400 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  50.36 
 
 
275 aa  265  7e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  51.47 
 
 
266 aa  256  3e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  41.84 
 
 
394 aa  242  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  44.25 
 
 
287 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 
376 aa  239  5e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  43.21 
 
 
397 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  48.34 
 
 
278 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  44.73 
 
 
281 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  47.23 
 
 
278 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  46.52 
 
 
282 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  45.23 
 
 
280 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0005  dihydropteroate synthase  39.24 
 
 
395 aa  230  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00021463  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  40.06 
 
 
397 aa  229  6e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
279 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
279 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  43.88 
 
 
270 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  40.35 
 
 
393 aa  226  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  39.76 
 
 
400 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  42.71 
 
 
311 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  41.49 
 
 
285 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 
291 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  43.45 
 
 
290 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 
302 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  39.31 
 
 
286 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
279 aa  217  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
278 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  42.76 
 
 
285 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  40.78 
 
 
347 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  40.44 
 
 
280 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  38.7 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 
258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  43.92 
 
 
291 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  40.62 
 
 
287 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  38.46 
 
 
303 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  41.3 
 
 
286 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
286 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 
277 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  38.83 
 
 
277 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  40.97 
 
 
277 aa  211  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
271 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  41.61 
 
 
280 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  38.49 
 
 
277 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  38.49 
 
 
277 aa  209  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  40.28 
 
 
277 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  40.48 
 
 
282 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  42.4 
 
 
274 aa  208  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  39.52 
 
 
277 aa  209  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  40 
 
 
274 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  40.28 
 
 
277 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
282 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
282 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  41.84 
 
 
303 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
282 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  40.14 
 
 
282 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
282 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 
277 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
282 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
282 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  40.44 
 
 
277 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
282 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  41.88 
 
 
284 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  39.45 
 
 
279 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  40.77 
 
 
283 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  40.22 
 
 
284 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  39.1 
 
 
274 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  40.59 
 
 
277 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  40.59 
 
 
277 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  41.37 
 
 
269 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
276 aa  205  8e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  40.29 
 
 
280 aa  205  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  39.58 
 
 
277 aa  205  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  40.34 
 
 
299 aa  205  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  39.49 
 
 
345 aa  204  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  39.86 
 
 
273 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  43.21 
 
 
286 aa  205  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  41.37 
 
 
269 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  40.56 
 
 
291 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  43.14 
 
 
278 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  39.42 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  39.71 
 
 
282 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09051  putative dihydropteroate synthase  40.66 
 
 
280 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249023  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  39.63 
 
 
303 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
413 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  39.71 
 
 
402 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  38.81 
 
 
276 aa  203  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  38.83 
 
 
277 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  38.14 
 
 
277 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  39.48 
 
 
345 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  41.42 
 
 
279 aa  203  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  39.21 
 
 
277 aa  203  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  39.57 
 
 
277 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  39.63 
 
 
277 aa  202  8e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  39.57 
 
 
280 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  39.57 
 
 
280 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  39.57 
 
 
280 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  41.96 
 
 
278 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>