More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2317 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  100 
 
 
294 aa  578  1e-164  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  43.66 
 
 
400 aa  246  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  53.01 
 
 
276 aa  243  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
376 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  48.12 
 
 
286 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  43.66 
 
 
287 aa  236  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  42.55 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 
278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  48.7 
 
 
298 aa  232  5e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  51.52 
 
 
272 aa  232  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  48.6 
 
 
400 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 
278 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
266 aa  231  1e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  48.5 
 
 
279 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  44.98 
 
 
277 aa  230  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  46.94 
 
 
291 aa  228  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
280 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  50.92 
 
 
291 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 
278 aa  226  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  52.38 
 
 
298 aa  225  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  48.03 
 
 
331 aa  225  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  41.3 
 
 
275 aa  224  9e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  47.37 
 
 
264 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 
278 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  47.37 
 
 
264 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  48.87 
 
 
278 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  48.31 
 
 
413 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 
345 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  44.56 
 
 
286 aa  222  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  53.99 
 
 
284 aa  221  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  47.74 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  51.33 
 
 
271 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  48.28 
 
 
289 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12107  predicted protein  46.79 
 
 
460 aa  219  3e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  47.1 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
285 aa  218  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 
276 aa  218  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 
284 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0549  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 
267 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0536  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 
267 aa  218  8.999999999999998e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0712347  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  51 
 
 
298 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  43.88 
 
 
274 aa  217  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 
277 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
270 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
290 aa  215  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
385 aa  216  5e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  42.47 
 
 
259 aa  215  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 
277 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
269 aa  215  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2900  dihydropteroate synthase  51.03 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  45.25 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  44.12 
 
 
287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 
282 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
356 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  41.39 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  47.39 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  38.6 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  45.23 
 
 
347 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  44.87 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  43.57 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  43.82 
 
 
282 aa  212  7.999999999999999e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
277 aa  211  9e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  48.69 
 
 
396 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  43.45 
 
 
282 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  45.32 
 
 
277 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  45.25 
 
 
277 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  42.08 
 
 
259 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 
267 aa  210  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09371  putative dihydropteroate synthase  37.74 
 
 
299 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783824 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 
297 aa  210  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  43.45 
 
 
277 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0153  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
272 aa  209  3e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.77759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 
394 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  46.67 
 
 
437 aa  210  3e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  49.4 
 
 
435 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  44.87 
 
 
277 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
393 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 
282 aa  209  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
277 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>