More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1862 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 345 aa  665    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  97.97 
 
 		 345 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0648  dihydropteroate synthase  85.8 
 
 		 345 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2398  dihydropteroate synthase  64.35 
 
 		 337 aa  377  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  60 
 
 		 331 aa  361  9e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2726  dihydropteroate synthase  58.13 
 
 		 336 aa  332  8e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0544  dihydropteroate synthase  58.73 
 
 		 323 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4577  dihydropteroate synthase  57.09 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1099  dihydropteroate synthase  50.7 
 
 		 396 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  51.85 
 
 		 276 aa  271  8.000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  51.17 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 		 274 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  51.48 
 
 		 278 aa  260  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 		 287 aa  260  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  48.76 
 
 		 368 aa  258  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  51.09 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  48.84 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  52.78 
 
 		 259 aa  257  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  52.09 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 		 277 aa  256  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 		 277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  51.32 
 
 		 277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  49.63 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  52.76 
 
 		 286 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 		 277 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 		 282 aa  253  5.000000000000001e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  50.94 
 
 		 277 aa  252  6e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 277 aa  252  8.000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  49.26 
 
 		 277 aa  251  9.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  51.32 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  51.3 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  51.32 
 
 		 277 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  53.16 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  51.2 
 
 		 280 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  48.3 
 
 		 282 aa  250  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 		 284 aa  250  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 		 282 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 		 277 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 		 277 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  53.53 
 
 		 279 aa  249  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  51 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  51 
 
 		 279 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 		 277 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  51.47 
 
 		 283 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  51.13 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  49.44 
 
 		 282 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  49.44 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  50.94 
 
 		 279 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  49.44 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  49.44 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  49.44 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  50.34 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  50.74 
 
 		 283 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0966  dihydropteroate synthase  45.58 
 
 		 376 aa  243  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  49.06 
 
 		 277 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  53.58 
 
 		 276 aa  242  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  53.03 
 
 		 275 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  49.26 
 
 		 283 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  49.06 
 
 		 277 aa  241  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  50.54 
 
 		 298 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  51.52 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  47.37 
 
 		 280 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 		 275 aa  240  2.9999999999999997e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  51.1 
 
 		 291 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 266 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  49.26 
 
 		 283 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 		 291 aa  238  9e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  51.16 
 
 		 258 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  48.68 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  38.56 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  47.73 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  50.51 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 275 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 283 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 		 306 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 283 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 		 277 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 278 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>