More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13508 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  100 
 
 		 283 aa  583  1.0000000000000001e-165  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  57.78 
 
 		 273 aa  348  8e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  54.21 
 
 		 272 aa  318  6e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  56.18 
 
 		 286 aa  318  9e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  53.68 
 
 		 286 aa  304  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_002950  PG1589  dihydropteroate synthase  52.01 
 
 		 281 aa  297  1e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.864925 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3663  dihydropteroate synthase  54.68 
 
 		 288 aa  292  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0223  dihydropteroate synthase  48.73 
 
 		 283 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000034848  normal  0.0279297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  48.19 
 
 		 286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  42.16 
 
 		 278 aa  238  8e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  43.41 
 
 		 275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  42.96 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  41.76 
 
 		 277 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 		 277 aa  232  5e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  45.95 
 
 		 287 aa  231  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 		 277 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 		 277 aa  231  8.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  42.55 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  39.73 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  44.44 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 		 277 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  40.78 
 
 		 283 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  42.49 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 		 277 aa  226  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  45.35 
 
 		 266 aa  225  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  42.48 
 
 		 282 aa  225  8e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 		 283 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 		 277 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 		 283 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  43.12 
 
 		 282 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  40.28 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  39.78 
 
 		 283 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 		 282 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 		 277 aa  221  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  41.76 
 
 		 283 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  40.29 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  41.03 
 
 		 283 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  42.59 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  40.36 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 		 282 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 		 277 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  42.49 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  41.39 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 397 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 		 259 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  39.05 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  40.29 
 
 		 283 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  41.47 
 
 		 258 aa  215  7e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  43.3 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  38.6 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  41.09 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  41.13 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  40.83 
 
 		 303 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  37.81 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  40.45 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  40.45 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  39.13 
 
 		 276 aa  209  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  41.13 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  43.43 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 		 282 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  40.77 
 
 		 356 aa  206  3e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 		 279 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  42.02 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 399 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  40.36 
 
 		 282 aa  205  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 285 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1647  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 		 380 aa  205  7e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000944705  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  40.38 
 
 		 284 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  40.44 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  38.46 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1969  dihydropteroate synthase  41.11 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000758372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  41.57 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1374  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 		 380 aa  203  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000647265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 		 376 aa  202  4e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  38.69 
 
 		 314 aa  202  7e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  35.96 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  38.16 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  38.41 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>