More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2523 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  100 
 
 
413 aa  826    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  63.27 
 
 
400 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  50.89 
 
 
394 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  46.19 
 
 
393 aa  334  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  60.73 
 
 
278 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  60 
 
 
278 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  62.99 
 
 
303 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  48.22 
 
 
396 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  45.5 
 
 
407 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  45.23 
 
 
394 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  58.7 
 
 
290 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  46.17 
 
 
402 aa  309  5e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  62.09 
 
 
284 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  46.35 
 
 
399 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  44.47 
 
 
412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  55.76 
 
 
306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  39.27 
 
 
400 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 
397 aa  276  5e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  51.91 
 
 
287 aa  273  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  50.92 
 
 
270 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  53.82 
 
 
279 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  53.82 
 
 
279 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  50.9 
 
 
279 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  51.53 
 
 
285 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
280 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  39.8 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  49.28 
 
 
283 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  41.73 
 
 
418 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  50.92 
 
 
285 aa  250  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 
277 aa  249  5e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  50 
 
 
282 aa  249  6e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  43.57 
 
 
347 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 
277 aa  245  8e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  48.09 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  48.09 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 
280 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 
277 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  52.61 
 
 
291 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
286 aa  243  3e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 
277 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 
274 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 
277 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  54.07 
 
 
283 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  50.39 
 
 
277 aa  243  6e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  51.15 
 
 
278 aa  241  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  52.85 
 
 
283 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 
281 aa  239  9e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  49.05 
 
 
286 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  42.32 
 
 
817 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.13 
 
 
436 aa  237  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  54.47 
 
 
283 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  43.45 
 
 
278 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  50.41 
 
 
258 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 
278 aa  233  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  41.44 
 
 
813 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 
316 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  48.31 
 
 
294 aa  232  9e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  48.08 
 
 
274 aa  232  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.31 
 
 
437 aa  231  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  45.9 
 
 
376 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
266 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1647  dihydropteroate synthase  36.77 
 
 
380 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000944705  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 
269 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 
272 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  52.27 
 
 
278 aa  230  3e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  49.44 
 
 
345 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 
269 aa  230  4e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  52.21 
 
 
289 aa  230  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  47.73 
 
 
275 aa  229  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  49.44 
 
 
345 aa  229  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 
291 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1374  dihydropteroate synthase  36.5 
 
 
380 aa  228  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000647265  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12107  predicted protein  48.91 
 
 
460 aa  228  2e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  48.26 
 
 
286 aa  227  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  52 
 
 
295 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  48.92 
 
 
283 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  48.52 
 
 
298 aa  226  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 
302 aa  226  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 
284 aa  225  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  48.06 
 
 
291 aa  225  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  47.01 
 
 
274 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  48.36 
 
 
282 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  53.2 
 
 
279 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  52.21 
 
 
289 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  46.4 
 
 
297 aa  222  8e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 
283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  54.66 
 
 
280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  48.28 
 
 
283 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  53.1 
 
 
271 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
280 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  44.87 
 
 
280 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 
282 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  44.8 
 
 
286 aa  219  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  50.2 
 
 
291 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
282 aa  219  7e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  47.89 
 
 
286 aa  219  7e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
356 aa  219  7.999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>