More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0802 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  100 
 
 
277 aa  568  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  97.11 
 
 
277 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  81.52 
 
 
277 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  81.52 
 
 
277 aa  457  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  81.16 
 
 
277 aa  454  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  76.9 
 
 
277 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  77.54 
 
 
277 aa  441  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  73.65 
 
 
277 aa  434  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  74.01 
 
 
282 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  74.01 
 
 
282 aa  431  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  74.01 
 
 
282 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  74.01 
 
 
282 aa  431  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  74.01 
 
 
282 aa  431  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  74.01 
 
 
282 aa  431  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  74.01 
 
 
282 aa  431  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  74.01 
 
 
282 aa  431  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  73.65 
 
 
282 aa  430  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  74.01 
 
 
282 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  72.46 
 
 
282 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  72.46 
 
 
282 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  72.1 
 
 
282 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  72.46 
 
 
282 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  72.1 
 
 
282 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  62.09 
 
 
288 aa  360  1e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  62.73 
 
 
282 aa  359  3e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  62.87 
 
 
276 aa  358  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  60.51 
 
 
279 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  59.34 
 
 
277 aa  353  1e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  60.29 
 
 
277 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  60.29 
 
 
277 aa  351  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  59.93 
 
 
277 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  60.66 
 
 
277 aa  350  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  62.12 
 
 
274 aa  346  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  62.75 
 
 
259 aa  345  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  58.82 
 
 
277 aa  341  9e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  58.46 
 
 
277 aa  338  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  59.49 
 
 
287 aa  338  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  58.09 
 
 
277 aa  338  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  58.46 
 
 
284 aa  337  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  58.09 
 
 
277 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  56.2 
 
 
280 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  57.09 
 
 
275 aa  335  7e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  59.62 
 
 
278 aa  333  3e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  60.37 
 
 
283 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  60 
 
 
283 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  58.27 
 
 
279 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  57.35 
 
 
280 aa  328  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  54.87 
 
 
277 aa  325  4.0000000000000003e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  57.78 
 
 
283 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  57.41 
 
 
283 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  58.8 
 
 
283 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  58.43 
 
 
283 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  53.93 
 
 
282 aa  311  9e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  59.92 
 
 
283 aa  311  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  57.78 
 
 
283 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  58.05 
 
 
283 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  59.92 
 
 
283 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  56.36 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  56.98 
 
 
290 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  55.64 
 
 
286 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  52.19 
 
 
279 aa  300  2e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  54.92 
 
 
278 aa  296  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42870  dihydropteroate synthase  57.45 
 
 
282 aa  295  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.307408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  50.74 
 
 
286 aa  291  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  52.76 
 
 
277 aa  289  4e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  57.71 
 
 
286 aa  289  4e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  59.47 
 
 
278 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  50.76 
 
 
275 aa  272  5.000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  53.14 
 
 
298 aa  271  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1969  dihydropteroate synthase  50.36 
 
 
285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000758372  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  51.66 
 
 
277 aa  268  7e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  53.7 
 
 
290 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  54.55 
 
 
307 aa  266  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  53.76 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  52.96 
 
 
258 aa  265  8e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  49.42 
 
 
264 aa  260  1e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  49.42 
 
 
264 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1974  dihydropteroate synthase  57.48 
 
 
298 aa  259  4e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490177 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  52.87 
 
 
298 aa  258  6e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  53.1 
 
 
291 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  52.57 
 
 
297 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 
298 aa  255  6e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2900  dihydropteroate synthase  57.28 
 
 
277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2019  dihydropteroate synthase  46.27 
 
 
307 aa  251  7e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 
299 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 
303 aa  249  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 
281 aa  249  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  51.09 
 
 
296 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  51.09 
 
 
296 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  50.73 
 
 
296 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  50.73 
 
 
296 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  50.73 
 
 
296 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  53.26 
 
 
298 aa  248  1e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  50.73 
 
 
296 aa  247  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  51.46 
 
 
332 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  50.73 
 
 
296 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  51.37 
 
 
265 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  51.76 
 
 
265 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  51.16 
 
 
316 aa  243  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  47.29 
 
 
287 aa  241  9e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>