More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2733 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  100 
 
 
284 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  65.36 
 
 
290 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  66.55 
 
 
303 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  65.82 
 
 
278 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  64.36 
 
 
278 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  59.93 
 
 
400 aa  321  9.000000000000001e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  62.09 
 
 
413 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  53.7 
 
 
270 aa  276  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  57.41 
 
 
306 aa  271  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  51.26 
 
 
393 aa  268  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  48.72 
 
 
287 aa  264  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  49.28 
 
 
279 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  55.28 
 
 
397 aa  257  2e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 
286 aa  256  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  47.99 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  53.53 
 
 
394 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  49.44 
 
 
285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
283 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  50.36 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  50.36 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  51.69 
 
 
394 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
280 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  45.83 
 
 
291 aa  248  1e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  50.9 
 
 
291 aa  245  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  48.89 
 
 
402 aa  243  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  47.96 
 
 
277 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
291 aa  242  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 
277 aa  242  5e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
269 aa  242  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  47.96 
 
 
280 aa  241  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  47.96 
 
 
280 aa  241  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  47.96 
 
 
280 aa  241  9e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  47.96 
 
 
280 aa  241  9e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  47.96 
 
 
280 aa  241  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  47.96 
 
 
277 aa  241  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  52.03 
 
 
396 aa  240  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 
286 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  46.84 
 
 
277 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 
277 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  45.79 
 
 
269 aa  240  2e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  47.14 
 
 
287 aa  239  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  49.3 
 
 
418 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  48.73 
 
 
283 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
347 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  50.78 
 
 
283 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  50.2 
 
 
283 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  47.96 
 
 
399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  50 
 
 
272 aa  235  6e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  47.76 
 
 
407 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  46.55 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  52.65 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  51.54 
 
 
271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  45 
 
 
412 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  54.88 
 
 
280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  47.23 
 
 
279 aa  232  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  48.54 
 
 
289 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 
275 aa  231  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
277 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  48.28 
 
 
278 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  49.42 
 
 
376 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  47.08 
 
 
289 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  47.51 
 
 
278 aa  229  5e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
286 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
356 aa  227  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  48.48 
 
 
282 aa  227  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  49.63 
 
 
278 aa  227  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
281 aa  226  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  43.31 
 
 
397 aa  226  3e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  46.84 
 
 
274 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 
274 aa  225  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
301 aa  225  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  46.32 
 
 
302 aa  225  7e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 
283 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  46.54 
 
 
279 aa  224  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  45.2 
 
 
283 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 
266 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  48.3 
 
 
294 aa  224  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 
283 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0499  dihydropteroate synthase  48.4 
 
 
296 aa  222  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.491755  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  51.43 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  45.1 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  48.69 
 
 
345 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  48.63 
 
 
282 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  48.63 
 
 
282 aa  221  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  48.63 
 
 
282 aa  221  8e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  48.63 
 
 
282 aa  221  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  48.63 
 
 
282 aa  221  8e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  45.68 
 
 
284 aa  221  8e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  48.63 
 
 
282 aa  221  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  48.63 
 
 
282 aa  221  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  48.63 
 
 
282 aa  221  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  48.24 
 
 
282 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  46.4 
 
 
282 aa  219  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  44.71 
 
 
277 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  48.31 
 
 
345 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  46.51 
 
 
258 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  44.71 
 
 
277 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 
280 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  47.6 
 
 
291 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>