More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1012 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 287 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  56.94 
 
 		 296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  56.94 
 
 		 296 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  56.94 
 
 		 296 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  56.94 
 
 		 296 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  56.94 
 
 		 296 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  56.6 
 
 		 296 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  56.6 
 
 		 296 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  54.77 
 
 		 299 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  56.38 
 
 		 291 aa  308  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  55.56 
 
 		 332 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  56.32 
 
 		 316 aa  298  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  55.23 
 
 		 280 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  57.98 
 
 		 265 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  55.94 
 
 		 270 aa  293  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4440  dihydropteroate synthase  56.99 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2022  dihydropteroate synthase  56.1 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  56.81 
 
 		 265 aa  288  8e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1175  dihydropteroate synthase  56.99 
 
 		 313 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0817  dihydropteroate synthase  56.64 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1298  dihydropteroate synthase  56.64 
 
 		 299 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587592  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  52.94 
 
 		 275 aa  285  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1187  dihydropteroate synthase  56.64 
 
 		 313 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.243089 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4924  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 278 aa  281  6.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  57.69 
 
 		 289 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  50.54 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  51.09 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2610  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  50.36 
 
 		 283 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2851  dihydropteroate synthase  50.88 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.668337 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1269  dihydropteroate synthase  56.64 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.870569 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  52.55 
 
 		 298 aa  269  4e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  52.33 
 
 		 278 aa  269  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  51.53 
 
 		 286 aa  268  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  50.72 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 277 aa  266  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  50.77 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1269  dihydropteroate synthase  55.47 
 
 		 278 aa  262  4e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0477565  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  51.16 
 
 		 276 aa  261  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  49.23 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  49.23 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 284 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 277 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  48.73 
 
 		 286 aa  258  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 277 aa  258  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 		 279 aa  256  2e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  46.88 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  50.76 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 		 286 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  48.46 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  48.92 
 
 		 298 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  47.5 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  51.74 
 
 		 281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 		 276 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  46.43 
 
 		 283 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 283 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  49.29 
 
 		 290 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  48.11 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  48.43 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 		 297 aa  245  6e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 		 277 aa  244  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  50.56 
 
 		 435 aa  244  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  51.15 
 
 		 290 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  45.68 
 
 		 283 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2012  dihydropteroate synthase  46.08 
 
 		 292 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  47.35 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  44.96 
 
 		 283 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1737  dihydropteroate synthase  49.64 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.429553  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  48.45 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  47.45 
 
 		 287 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 286 aa  238  6.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  44.29 
 
 		 283 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  46.86 
 
 		 277 aa  238  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  46.52 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 277 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1974  dihydropteroate synthase  51.11 
 
 		 298 aa  236  3e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490177 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  44.29 
 
 		 283 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  45.95 
 
 		 282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 		 277 aa  235  5.0000000000000005e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  48.08 
 
 		 307 aa  235  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  45.56 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  45.35 
 
 		 275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>