More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1476 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  99.29 
 
 
283 aa  567  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  72.46 
 
 
286 aa  410  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  77.1 
 
 
299 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4924  dihydropteroate synthase  72.36 
 
 
278 aa  401  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0654969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2851  dihydropteroate synthase  70 
 
 
293 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.668337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2610  dihydropteroate synthase  70.82 
 
 
283 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  71.02 
 
 
292 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2012  dihydropteroate synthase  69.18 
 
 
292 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  63.84 
 
 
275 aa  335  7e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1269  dihydropteroate synthase  65.57 
 
 
278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0477565  normal  0.330181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  54.55 
 
 
299 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  55.64 
 
 
316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  58.02 
 
 
289 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  56.27 
 
 
291 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  52.21 
 
 
279 aa  273  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1263  dihydropteroate synthase  56.49 
 
 
270 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  54.74 
 
 
280 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  54.44 
 
 
265 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  56.63 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  56.63 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  56.63 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  56.63 
 
 
296 aa  265  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  56.27 
 
 
296 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  56.27 
 
 
296 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  55.91 
 
 
296 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4440  dihydropteroate synthase  56.07 
 
 
299 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943792  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  55.56 
 
 
332 aa  261  1e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  54.05 
 
 
265 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2022  dihydropteroate synthase  56.79 
 
 
313 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  50 
 
 
287 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0817  dihydropteroate synthase  56.63 
 
 
299 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1298  dihydropteroate synthase  56.63 
 
 
299 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587592  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  51.89 
 
 
298 aa  251  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1269  dihydropteroate synthase  56.63 
 
 
299 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.870569 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1175  dihydropteroate synthase  54.96 
 
 
313 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  47.53 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  47.84 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  49.26 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  52.47 
 
 
281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
287 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  49.05 
 
 
277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1187  dihydropteroate synthase  53.55 
 
 
313 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 
290 aa  239  4e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  48.86 
 
 
282 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  48.86 
 
 
282 aa  237  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  46.51 
 
 
286 aa  236  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  48.86 
 
 
282 aa  237  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  48.86 
 
 
282 aa  237  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  48.86 
 
 
282 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  48.86 
 
 
282 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  48.86 
 
 
282 aa  237  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  48.86 
 
 
282 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  48.86 
 
 
282 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  45.29 
 
 
274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 
277 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  47.37 
 
 
279 aa  235  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
277 aa  235  7e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  45.26 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  45.26 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 
276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 
277 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  46.84 
 
 
278 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  51.41 
 
 
286 aa  232  6e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  47.01 
 
 
282 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  47.65 
 
 
275 aa  231  7.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 
282 aa  231  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  47.53 
 
 
279 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 
277 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  51.72 
 
 
298 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 
280 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 
279 aa  230  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  50 
 
 
283 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  49.07 
 
 
301 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1737  dihydropteroate synthase  52.61 
 
 
276 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.429553  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
397 aa  229  4e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
277 aa  229  4e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  51.33 
 
 
307 aa  228  7e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  44.64 
 
 
280 aa  228  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  45 
 
 
259 aa  228  9e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  49.21 
 
 
283 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 
277 aa  228  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  46.42 
 
 
277 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  50.96 
 
 
298 aa  226  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  46.51 
 
 
400 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 
277 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
286 aa  226  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 
277 aa  225  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 
283 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 
276 aa  225  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  48.43 
 
 
283 aa  225  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
284 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
282 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
282 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
282 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  44.87 
 
 
277 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
282 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
277 aa  223  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  47.76 
 
 
283 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  46.84 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>