More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1485 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  91.84 
 
 		 282 aa  521  1e-147  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  83.69 
 
 		 282 aa  479  1e-134  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  54.18 
 
 		 393 aa  309  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  52.79 
 
 		 394 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  51.13 
 
 		 269 aa  271  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  50.75 
 
 		 269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  51.74 
 
 		 402 aa  265  5e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  52.81 
 
 		 396 aa  259  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 270 aa  255  5e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  51.12 
 
 		 399 aa  251  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  51.3 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 274 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 277 aa  250  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 		 277 aa  249  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 280 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 280 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  47.91 
 
 		 280 aa  248  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  47.91 
 
 		 280 aa  248  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 277 aa  248  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 280 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  47.53 
 
 		 277 aa  248  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  47.53 
 
 		 286 aa  248  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  46.52 
 
 		 274 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 		 418 aa  236  3e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 		 400 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  46.86 
 
 		 407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  48.33 
 
 		 347 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  44.04 
 
 		 281 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  46.27 
 
 		 278 aa  223  4e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 		 278 aa  221  8e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  45.79 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  45.79 
 
 		 279 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  41.84 
 
 		 412 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  44.93 
 
 		 290 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 		 397 aa  207  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 		 279 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  47.21 
 
 		 303 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  45.04 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  46.22 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  45.04 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  41.3 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  45.74 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  41.38 
 
 		 275 aa  202  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 285 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  47.76 
 
 		 278 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  42.49 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  45.08 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 		 413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  45.68 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.26 
 
 		 282 aa  192  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  41.3 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  43.7 
 
 		 291 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  38.61 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  38.22 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  40.46 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  40.46 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 289 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  40.08 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  43.95 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  40.08 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  40.08 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  40.08 
 
 		 282 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  42.31 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10401  putative dihydropteroate synthase  39.78 
 
 		 281 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  39.71 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  43.44 
 
 		 279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  43.95 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  41.27 
 
 		 392 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  45.9 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  43.31 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  43.68 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  42.13 
 
 		 262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  41.41 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>