More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0097 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  100 
 
 
412 aa  822    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  47.65 
 
 
402 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  45.05 
 
 
393 aa  349  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  47.5 
 
 
396 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 
399 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  47.01 
 
 
394 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  46.53 
 
 
394 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
407 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  44.56 
 
 
400 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  44.47 
 
 
413 aa  294  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  39.34 
 
 
397 aa  271  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  48.21 
 
 
270 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  39.46 
 
 
400 aa  260  4e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  36.79 
 
 
397 aa  256  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  47.14 
 
 
283 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  44.71 
 
 
280 aa  249  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  44.37 
 
 
280 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.37 
 
 
280 aa  248  2e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.37 
 
 
280 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  44.37 
 
 
280 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  44.37 
 
 
277 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 
285 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  43.69 
 
 
286 aa  246  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  43.69 
 
 
277 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 
277 aa  243  5e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 
274 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  42.09 
 
 
277 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  43.34 
 
 
277 aa  239  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  38.4 
 
 
817 aa  237  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  43.42 
 
 
269 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 
274 aa  236  7e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  43.06 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  44.04 
 
 
287 aa  229  6e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  36.07 
 
 
813 aa  229  6e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  43.27 
 
 
278 aa  228  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  43.33 
 
 
278 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  42.55 
 
 
278 aa  226  7e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  46.32 
 
 
278 aa  225  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3166  dihydropteroate synthase  36.1 
 
 
418 aa  223  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00152005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  44.68 
 
 
281 aa  222  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  44.25 
 
 
279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  47.37 
 
 
291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  44.25 
 
 
279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  44.88 
 
 
303 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
277 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 
290 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  44.41 
 
 
283 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  44.33 
 
 
280 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 
280 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  35.84 
 
 
810 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  44.6 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  44.96 
 
 
274 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  43.66 
 
 
285 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 
277 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  43.6 
 
 
283 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 
283 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  41.84 
 
 
284 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  44.41 
 
 
283 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  45 
 
 
280 aa  209  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  41.5 
 
 
282 aa  208  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  41.39 
 
 
266 aa  208  2e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  41.37 
 
 
278 aa  206  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 
277 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
286 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  43.43 
 
 
282 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  37.8 
 
 
347 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  45 
 
 
284 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  39.37 
 
 
302 aa  202  7e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  41.32 
 
 
282 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  40.97 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  40.97 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 
279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  40.97 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  42.09 
 
 
286 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  41.96 
 
 
283 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  40.97 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  40.97 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  40.97 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  40.97 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  40.97 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 
345 aa  200  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  41.86 
 
 
258 aa  200  5e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  40.71 
 
 
282 aa  199  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 
262 aa  200  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  39.77 
 
 
283 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  41.82 
 
 
282 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  40 
 
 
376 aa  199  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 
345 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  37.76 
 
 
289 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
314 aa  199  9e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  41.58 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
278 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>