More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2233 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  100 
 
 
292 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  81.75 
 
 
294 aa  477  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  72.56 
 
 
285 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  73.85 
 
 
392 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  71.81 
 
 
285 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  75.38 
 
 
288 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  69.29 
 
 
285 aa  346  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  52.36 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  54.72 
 
 
295 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  53.54 
 
 
278 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  55.12 
 
 
289 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  54.72 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  54.72 
 
 
289 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  54.33 
 
 
289 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  48.81 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  48.41 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  48.19 
 
 
270 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  45.96 
 
 
286 aa  222  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  46.03 
 
 
394 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  46.86 
 
 
283 aa  218  6e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  38.54 
 
 
397 aa  217  1e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  48.41 
 
 
394 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1581  dihydropteroate synthase  51.34 
 
 
290 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.239571 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  44.84 
 
 
402 aa  213  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  46.31 
 
 
285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
264 aa  209  5e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  47.22 
 
 
396 aa  208  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 
277 aa  208  8e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 
264 aa  208  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  45.95 
 
 
279 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  45.95 
 
 
279 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
277 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 
286 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
274 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 
277 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 
280 aa  205  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 
279 aa  204  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 
277 aa  205  9e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  44.7 
 
 
279 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 
280 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.81 
 
 
280 aa  204  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.81 
 
 
280 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 
280 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  45.95 
 
 
272 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
400 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 
277 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  46.09 
 
 
283 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  47.64 
 
 
282 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
279 aa  203  3e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  44.14 
 
 
258 aa  202  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
277 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
277 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  42.98 
 
 
269 aa  202  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  42.98 
 
 
269 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  42.46 
 
 
277 aa  201  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  41.82 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  41.45 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  45.7 
 
 
283 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  43.59 
 
 
279 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  42.96 
 
 
282 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 
276 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  45.08 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  42.11 
 
 
274 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  45.7 
 
 
258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  41.73 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  42.15 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
262 aa  196  3e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
280 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  45.35 
 
 
271 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  42.24 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  42.24 
 
 
282 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  41.35 
 
 
277 aa  195  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  42.24 
 
 
282 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  41.73 
 
 
277 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  42.24 
 
 
282 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  41.85 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  42.25 
 
 
412 aa  195  7e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
282 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 
277 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  46.09 
 
 
283 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  42.7 
 
 
817 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
282 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0396  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 
302 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327356  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  41.35 
 
 
284 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  41.07 
 
 
282 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  41.73 
 
 
277 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>