More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3026 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  75.19 
 
 		 285 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  70.11 
 
 		 294 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  74.61 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  69.29 
 
 		 292 aa  361  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  70.68 
 
 		 285 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  73.44 
 
 		 288 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  56.64 
 
 		 257 aa  280  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  57.52 
 
 		 289 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  57.52 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  54.9 
 
 		 278 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  57.65 
 
 		 295 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  57.52 
 
 		 289 aa  255  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  57.25 
 
 		 279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 		 393 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  46.27 
 
 		 270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1581  dihydropteroate synthase  54.23 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.239571 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 		 394 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 		 274 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  49.41 
 
 		 396 aa  223  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 277 aa  222  7e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  43.13 
 
 		 397 aa  221  8e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  48.53 
 
 		 810 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 		 286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 277 aa  218  6e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 394 aa  218  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 280 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.87 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.87 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 277 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  46.46 
 
 		 279 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  43.55 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  43.55 
 
 		 269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 400 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  46.06 
 
 		 279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 		 274 aa  211  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 		 407 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  43.82 
 
 		 817 aa  208  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  46.9 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 		 402 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  46.99 
 
 		 281 aa  206  4e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  45.66 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  45.14 
 
 		 289 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  43.66 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  48.65 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  47.1 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  45.32 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  43.63 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  46.51 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  46.36 
 
 		 282 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  40.93 
 
 		 412 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 282 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  45.53 
 
 		 289 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  39.56 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  44.7 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0396  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  48.44 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  44.09 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  46.22 
 
 		 813 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>