More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1765 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 285 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  75.75 
 
 		 294 aa  411  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  75.09 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  71.97 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  72.56 
 
 		 292 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  75.19 
 
 		 285 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  73.76 
 
 		 288 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  57.25 
 
 		 257 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  55.48 
 
 		 295 aa  258  8e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  53.94 
 
 		 278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  56.3 
 
 		 289 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  58.27 
 
 		 279 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  57.48 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  56.3 
 
 		 289 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  49.6 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  47.22 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  47.2 
 
 		 270 aa  233  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1581  dihydropteroate synthase  52.49 
 
 		 290 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.239571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  45.88 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  45.7 
 
 		 402 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  48.36 
 
 		 285 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  46.27 
 
 		 283 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 		 286 aa  215  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  41 
 
 		 397 aa  215  8e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  46.9 
 
 		 279 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  44.05 
 
 		 277 aa  211  9e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  46.35 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  46.51 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  44.05 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.65 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.65 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  46.51 
 
 		 258 aa  206  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  41.27 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  41.27 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  46.03 
 
 		 396 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 		 399 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  43.21 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  45.04 
 
 		 272 aa  202  5e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  45.24 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  46.09 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 		 283 aa  199  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 		 264 aa  199  5e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 		 400 aa  198  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 		 810 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  44.61 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  51.34 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  50.96 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  46.69 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  41.98 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 		 286 aa  195  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  38.52 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  41.09 
 
 		 412 aa  194  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 287 aa  194  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  44.69 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  41.35 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 		 277 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  43.88 
 
 		 283 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  40.98 
 
 		 277 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  42.47 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  41.22 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  38.35 
 
 		 397 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 		 283 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  42.42 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 		 279 aa  190  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  42.42 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  44.14 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  44.14 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  40.98 
 
 		 277 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  42.69 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  43.22 
 
 		 289 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  40.61 
 
 		 278 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.45 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>