More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1581 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1581  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 290 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.239571 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  58.69 
 
 		 257 aa  308  5.9999999999999995e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  52.03 
 
 		 278 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  51.48 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  52.49 
 
 		 285 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  51.35 
 
 		 294 aa  248  6e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  49.45 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  52.03 
 
 		 279 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  49.06 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  51.34 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  54.23 
 
 		 285 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  49.27 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  49.82 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  50.39 
 
 		 392 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  49.23 
 
 		 285 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  50.97 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  48.12 
 
 		 402 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  46.42 
 
 		 394 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 		 274 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  46.27 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  42.24 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  48.69 
 
 		 394 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  43.27 
 
 		 289 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  40.38 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  40.38 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  45.39 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  41.99 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  41.99 
 
 		 279 aa  201  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  41.95 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  41.95 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  41.95 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  41.57 
 
 		 286 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 		 399 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 		 279 aa  198  7e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  43.13 
 
 		 286 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  40.68 
 
 		 397 aa  195  6e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  40.82 
 
 		 397 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 		 285 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  42.18 
 
 		 289 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 		 282 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 		 289 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 		 271 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  39.66 
 
 		 286 aa  189  4e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  43.13 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 		 396 aa  188  9e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 		 277 aa  188  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 		 258 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  38.43 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  42 
 
 		 290 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  43.85 
 
 		 282 aa  185  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  42.15 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  42.15 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  39.7 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  39.34 
 
 		 277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  39.33 
 
 		 264 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  42.2 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 		 278 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  38.97 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  41.76 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  41.83 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  38.97 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  38.6 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  44.84 
 
 		 278 aa  178  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 		 287 aa  178  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 280 aa  178  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  41.35 
 
 		 276 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  38.6 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  39.62 
 
 		 277 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 301 aa  176  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  41.42 
 
 		 282 aa  176  6e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  38.01 
 
 		 280 aa  175  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  40.61 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 		 291 aa  175  9e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  40.98 
 
 		 283 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  38.26 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 		 281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  44.04 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  43.31 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  39.85 
 
 		 283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 		 275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  36.86 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>