More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6218 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  100 
 
 
291 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  61.36 
 
 
486 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  63.26 
 
 
291 aa  298  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  61.62 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  58.43 
 
 
291 aa  278  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  60 
 
 
286 aa  278  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  56.92 
 
 
283 aa  273  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  53.99 
 
 
300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  56.98 
 
 
261 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  54.96 
 
 
280 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  54.17 
 
 
270 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  54.89 
 
 
268 aa  254  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  51.46 
 
 
314 aa  254  9e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  57.58 
 
 
351 aa  251  7e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  55.02 
 
 
302 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  53.03 
 
 
293 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  54.51 
 
 
286 aa  250  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  58.23 
 
 
269 aa  249  6e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  53.65 
 
 
304 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  56.52 
 
 
315 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  53.79 
 
 
275 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  53.79 
 
 
275 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  53.79 
 
 
275 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  57.14 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  52.45 
 
 
285 aa  242  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  54.9 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  58.56 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  46.94 
 
 
294 aa  228  7e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  54.1 
 
 
315 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0561  dihydropteroate synthase  54.38 
 
 
290 aa  222  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  52.96 
 
 
296 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
277 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.23 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.23 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  42.11 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  38.95 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  44.74 
 
 
279 aa  212  7e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
277 aa  212  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
287 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  45.08 
 
 
285 aa  210  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
397 aa  210  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
277 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0638  dihydropteroate synthase  50 
 
 
288 aa  209  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 
271 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  44.15 
 
 
285 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0850  dihydropteroate synthase  55.43 
 
 
318 aa  209  5e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 
283 aa  208  7e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  42.48 
 
 
277 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
284 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01260  Dihydropteroate synthase  50.97 
 
 
305 aa  207  2e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  42.48 
 
 
277 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  41.64 
 
 
280 aa  207  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  42.07 
 
 
274 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  46.06 
 
 
436 aa  205  9e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  41.11 
 
 
277 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  41.11 
 
 
277 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  50 
 
 
306 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  42.11 
 
 
277 aa  204  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  52.78 
 
 
280 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  42.54 
 
 
280 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
286 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  42.54 
 
 
303 aa  204  2e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 
278 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  45.69 
 
 
331 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  40.45 
 
 
277 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 
413 aa  202  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  44.61 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  48.61 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  43.91 
 
 
394 aa  201  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  48.61 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  44.65 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  39.42 
 
 
281 aa  201  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  40.74 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  42.63 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  40.67 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  41.35 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  41.35 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 
291 aa  199  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  43.94 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
393 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  41.64 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  41.64 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  43.33 
 
 
283 aa  199  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  42.63 
 
 
259 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
277 aa  199  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  46.67 
 
 
368 aa  199  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  41.29 
 
 
259 aa  199  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  41.35 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 
282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>