More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1841 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 368 aa  727    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0966  dihydropteroate synthase  52.22 
 
 		 376 aa  329  4e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4577  dihydropteroate synthase  52.45 
 
 		 371 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  49.04 
 
 		 345 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  48.76 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  51.31 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  49.26 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  49.45 
 
 		 277 aa  237  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  53.05 
 
 		 276 aa  232  8.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 		 277 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 		 277 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  47.81 
 
 		 283 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0648  dihydropteroate synthase  48.01 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  47.81 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  47.96 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 258 aa  227  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  47.81 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1099  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 		 396 aa  226  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 277 aa  225  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 277 aa  225  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2726  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 		 336 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2398  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 337 aa  225  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  47.45 
 
 		 283 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  47.76 
 
 		 277 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 283 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  43.33 
 
 		 400 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.61 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  47.08 
 
 		 298 aa  219  7.999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  47.37 
 
 		 272 aa  219  7.999999999999999e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 		 277 aa  219  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0816  dihydropteroate synthase  56.02 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 283 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  45.76 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  46.84 
 
 		 279 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 		 284 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  47.01 
 
 		 277 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  45.76 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  45.39 
 
 		 277 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  46.35 
 
 		 283 aa  215  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 		 282 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 		 286 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  45.76 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  46.56 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  47.7 
 
 		 297 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  44.28 
 
 		 278 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  45.39 
 
 		 280 aa  212  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  46.67 
 
 		 291 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09371  putative dihydropteroate synthase  38.63 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000783824 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  43.59 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 		 277 aa  210  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0544  dihydropteroate synthase  41.71 
 
 		 323 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  43.91 
 
 		 332 aa  209  5e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  45.99 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  42.81 
 
 		 286 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 266 aa  209  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4440  dihydropteroate synthase  45.3 
 
 		 299 aa  209  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  47.71 
 
 		 282 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  45.25 
 
 		 277 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  46.26 
 
 		 298 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  45.55 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  40.93 
 
 		 259 aa  207  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 		 288 aa  208  2e-52  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 		 281 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 		 296 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  40.54 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  45.99 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 270 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 		 296 aa  206  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  42.65 
 
 		 270 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  44.24 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  50.74 
 
 		 278 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42870  dihydropteroate synthase  48.33 
 
 		 282 aa  205  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.307408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  40.29 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  45.91 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  44.89 
 
 		 394 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>