More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4297 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  100 
 
 
486 aa  949    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  90.38 
 
 
291 aa  465  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  61.36 
 
 
291 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  65.79 
 
 
286 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  60.62 
 
 
270 aa  291  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  62.98 
 
 
261 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  59.7 
 
 
275 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  59.7 
 
 
275 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  59.7 
 
 
275 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  62.22 
 
 
282 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  56.04 
 
 
314 aa  277  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  59.09 
 
 
268 aa  277  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  60.56 
 
 
283 aa  275  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  59.16 
 
 
280 aa  271  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  59.14 
 
 
293 aa  270  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  56.3 
 
 
300 aa  266  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  60.16 
 
 
291 aa  262  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  59.22 
 
 
283 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  62.21 
 
 
351 aa  249  7e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  61.67 
 
 
315 aa  249  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  58.8 
 
 
285 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  57.74 
 
 
286 aa  246  9e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  54.2 
 
 
302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  64.66 
 
 
269 aa  243  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  51.9 
 
 
304 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0850  dihydropteroate synthase  64.26 
 
 
318 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  53.88 
 
 
306 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  57.45 
 
 
309 aa  226  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  58.4 
 
 
315 aa  226  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  58.62 
 
 
296 aa  225  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  48.8 
 
 
283 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0561  dihydropteroate synthase  56 
 
 
290 aa  223  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  57.99 
 
 
311 aa  223  7e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  55.2 
 
 
283 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 
274 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  43.3 
 
 
259 aa  220  6e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 
279 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 
280 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  56.57 
 
 
280 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  42.15 
 
 
259 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  43.59 
 
 
282 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  51.71 
 
 
271 aa  217  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 
298 aa  217  5e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 
277 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  53.6 
 
 
283 aa  216  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  40.6 
 
 
397 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  44.74 
 
 
277 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  47.6 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  45.67 
 
 
277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
286 aa  215  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  56.4 
 
 
283 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  41.33 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  51.37 
 
 
285 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  44.74 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  42.54 
 
 
277 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  42.54 
 
 
277 aa  213  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  44.09 
 
 
287 aa  213  5.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  51.55 
 
 
435 aa  212  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 
277 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
277 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 
277 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  44.09 
 
 
277 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  48.06 
 
 
436 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 
277 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  50.78 
 
 
311 aa  210  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  44.09 
 
 
280 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  46.09 
 
 
400 aa  209  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  47.94 
 
 
280 aa  209  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 
280 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.7 
 
 
280 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.7 
 
 
280 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 
279 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 
280 aa  209  1e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  44.09 
 
 
277 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 
277 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 
277 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 
281 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 
277 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  49.22 
 
 
413 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
286 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  42.42 
 
 
284 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 
277 aa  207  3e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  51.89 
 
 
278 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.94 
 
 
280 aa  207  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
368 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  47.6 
 
 
393 aa  207  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 
277 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 
280 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  47.97 
 
 
294 aa  206  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  48.89 
 
 
332 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 
298 aa  206  9e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
277 aa  206  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
277 aa  206  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  50 
 
 
278 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0638  dihydropteroate synthase  48.84 
 
 
288 aa  205  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  49.22 
 
 
278 aa  204  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  44.7 
 
 
287 aa  204  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  47.67 
 
 
385 aa  204  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 
279 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>