More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2398 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2398  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 337 aa  660    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  64.95 
 
 		 345 aa  362  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  64.35 
 
 		 345 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  57.49 
 
 		 331 aa  342  5.999999999999999e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0544  dihydropteroate synthase  59.45 
 
 		 323 aa  335  7.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0648  dihydropteroate synthase  63.64 
 
 		 345 aa  332  8e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2726  dihydropteroate synthase  57.45 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4577  dihydropteroate synthase  49.3 
 
 		 371 aa  260  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  49.25 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  52.4 
 
 		 286 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 286 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 		 279 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  51.94 
 
 		 271 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  47.91 
 
 		 280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  48.13 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  46.25 
 
 		 287 aa  232  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0966  dihydropteroate synthase  46.02 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 277 aa  229  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  47.01 
 
 		 282 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  45.85 
 
 		 281 aa  229  6e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1099  dihydropteroate synthase  52.45 
 
 		 396 aa  228  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 		 258 aa  228  9e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  47.17 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  47.17 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 		 286 aa  226  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 		 277 aa  225  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  48.03 
 
 		 259 aa  225  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  48.46 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  46.79 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 		 385 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 282 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 282 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  46.18 
 
 		 282 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 282 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 282 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 282 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 282 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 		 282 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 		 277 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 		 277 aa  222  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  45.8 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 		 277 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 		 275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  46.74 
 
 		 282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  48.06 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 282 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 282 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  47.66 
 
 		 282 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  47.78 
 
 		 279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 282 aa  219  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  47.54 
 
 		 298 aa  219  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  46.79 
 
 		 294 aa  218  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  46.48 
 
 		 282 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  51.17 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  47.92 
 
 		 306 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 		 307 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 		 279 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  47.81 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  47.86 
 
 		 400 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  48.89 
 
 		 297 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  46.3 
 
 		 283 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  47.81 
 
 		 298 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 		 283 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  48.7 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  46.97 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 288 aa  213  4.9999999999999996e-54  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  47.49 
 
 		 301 aa  212  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 277 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  48.31 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  47.47 
 
 		 413 aa  211  1e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.28 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  45.96 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  41.31 
 
 		 275 aa  211  1e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  46.56 
 
 		 277 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  39.56 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  45.1 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  45.2 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 		 291 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 		 276 aa  209  7e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  43.36 
 
 		 283 aa  209  8e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12107  predicted protein  45.13 
 
 		 460 aa  209  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 		 283 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 		 278 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>