More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4577 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4577  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 371 aa  736    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0966  dihydropteroate synthase  56.63 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  52.45 
 
 		 368 aa  336  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  52.5 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  52.09 
 
 		 345 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2398  dihydropteroate synthase  49.3 
 
 		 337 aa  266  5.999999999999999e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1099  dihydropteroate synthase  54.74 
 
 		 396 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  44.79 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0648  dihydropteroate synthase  58.9 
 
 		 345 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  49.45 
 
 		 274 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0544  dihydropteroate synthase  48.06 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 		 287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 		 277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  48.85 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 282 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 282 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  48.85 
 
 		 282 aa  231  2e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  49.81 
 
 		 282 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  47.55 
 
 		 282 aa  229  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  49.43 
 
 		 282 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  48.35 
 
 		 278 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  49.63 
 
 		 277 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  48.67 
 
 		 286 aa  225  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  46.49 
 
 		 280 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  50.75 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 298 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  52.92 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2726  dihydropteroate synthase  45.62 
 
 		 336 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1206  dihydropteroate synthase  51.24 
 
 		 357 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.728667  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  47.25 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  48.88 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 258 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  45.65 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  46.49 
 
 		 284 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 		 277 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  49.61 
 
 		 278 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  47.74 
 
 		 279 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  50 
 
 		 385 aa  220  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 		 282 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  46.49 
 
 		 277 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  46.49 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  46.49 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  46.86 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 		 277 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 		 277 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  47.39 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  47.53 
 
 		 277 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  48.34 
 
 		 277 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  45.9 
 
 		 280 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  47.51 
 
 		 275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 		 279 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  45.76 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  43.22 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  47.37 
 
 		 437 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  45.26 
 
 		 286 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  46.04 
 
 		 277 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 		 281 aa  213  5.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  45.93 
 
 		 276 aa  212  7.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  48.42 
 
 		 291 aa  211  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  47.6 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  47.57 
 
 		 283 aa  210  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  44.28 
 
 		 276 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 		 279 aa  210  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  49.45 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  45.68 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  47.41 
 
 		 290 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  45.93 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  45.71 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  46.57 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 259 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  46.62 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  44.6 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 264 aa  206  5e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  46.98 
 
 		 290 aa  206  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  44.23 
 
 		 264 aa  206  6e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1134  dihydropteroate synthase  50.94 
 
 		 281 aa  206  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  41.52 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0880  dihydropteroate synthase  44.29 
 
 		 280 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.0771022 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  46.88 
 
 		 436 aa  204  2e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>