More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1206 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1206  dihydropteroate synthase  100 
 
 
357 aa  691    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.728667  normal  0.841432 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 
277 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0816  dihydropteroate synthase  60.47 
 
 
278 aa  232  6e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
258 aa  231  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1099  dihydropteroate synthase  46.37 
 
 
396 aa  226  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
298 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00157  dihydropteroate synthase  50 
 
 
307 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
298 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
331 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4577  dihydropteroate synthase  51.24 
 
 
371 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  47.01 
 
 
298 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  51.27 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  51.27 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  49.03 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
281 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  48.48 
 
 
283 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  43.27 
 
 
298 aa  210  3e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  49.01 
 
 
278 aa  209  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  47.73 
 
 
283 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 
279 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 
279 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 
368 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  42.47 
 
 
303 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2019  dihydropteroate synthase  43.17 
 
 
307 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
274 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  44.27 
 
 
277 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
279 aa  206  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  45.67 
 
 
277 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  45.67 
 
 
277 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 
283 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
283 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2398  dihydropteroate synthase  50.35 
 
 
337 aa  204  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  44.96 
 
 
280 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 
283 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
280 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 
283 aa  203  4e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  41.13 
 
 
282 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
277 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
277 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  40.75 
 
 
282 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 
282 aa  202  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 
282 aa  202  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 
282 aa  202  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 
282 aa  202  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 
282 aa  202  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
277 aa  202  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  40.75 
 
 
282 aa  202  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  40.75 
 
 
282 aa  202  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0544  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  43.13 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  43.13 
 
 
282 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 
272 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 
278 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  43.13 
 
 
282 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  43.13 
 
 
282 aa  200  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  44.02 
 
 
277 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  49.8 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 
486 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  43.89 
 
 
279 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
277 aa  198  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  44.09 
 
 
277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  43.15 
 
 
287 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2726  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  43.02 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  45.88 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  45.74 
 
 
437 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
291 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0982  dihydropteroate synthase  50.57 
 
 
278 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 
277 aa  196  3e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  48.99 
 
 
283 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  41.44 
 
 
280 aa  196  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0648  dihydropteroate synthase  48.92 
 
 
345 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  44.8 
 
 
400 aa  195  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  46.3 
 
 
290 aa  194  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1969  dihydropteroate synthase  43.22 
 
 
285 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000758372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 
286 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  43.16 
 
 
283 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0966  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 
376 aa  194  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  48.84 
 
 
292 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
282 aa  194  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  47.84 
 
 
435 aa  194  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  41.91 
 
 
287 aa  193  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  43.16 
 
 
283 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  48.03 
 
 
304 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  44.71 
 
 
394 aa  193  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  50.2 
 
 
283 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  39.62 
 
 
288 aa  193  4e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 
277 aa  192  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 
284 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  40.62 
 
 
286 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  42.69 
 
 
278 aa  192  9e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>