More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4972 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  100 
 
 
300 aa  592  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  74.15 
 
 
302 aa  398  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  69.17 
 
 
283 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  68.8 
 
 
291 aa  345  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  59.71 
 
 
293 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  68.9 
 
 
269 aa  290  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  62.6 
 
 
309 aa  281  9e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  62.92 
 
 
286 aa  281  1e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  60.14 
 
 
351 aa  276  4e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  56.13 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  56.13 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  55.76 
 
 
275 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  58.84 
 
 
282 aa  269  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  53.7 
 
 
270 aa  266  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  53.99 
 
 
291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  55.43 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  54.61 
 
 
304 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  54.23 
 
 
314 aa  260  2e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  60.7 
 
 
311 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  56.3 
 
 
486 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  55.36 
 
 
286 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  55.09 
 
 
280 aa  256  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  56.49 
 
 
285 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  57.14 
 
 
261 aa  254  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  61.95 
 
 
315 aa  249  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  60.52 
 
 
315 aa  246  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  55.25 
 
 
283 aa  242  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  57.09 
 
 
291 aa  241  9e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  53.07 
 
 
285 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  46.32 
 
 
291 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01260  Dihydropteroate synthase  54.68 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  60.22 
 
 
296 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  55.47 
 
 
306 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  53.7 
 
 
311 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  44.6 
 
 
285 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0561  dihydropteroate synthase  54.26 
 
 
290 aa  221  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  52.77 
 
 
284 aa  219  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 
281 aa  216  5e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0850  dihydropteroate synthase  58.25 
 
 
318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  51.59 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
283 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  48.16 
 
 
301 aa  211  7.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  52.17 
 
 
280 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  43.91 
 
 
400 aa  210  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  51.98 
 
 
283 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  40.54 
 
 
259 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
280 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  40.54 
 
 
259 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  50.79 
 
 
283 aa  208  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
287 aa  207  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  39.1 
 
 
397 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  40.51 
 
 
277 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 
278 aa  206  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  47.08 
 
 
294 aa  205  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  47.67 
 
 
298 aa  205  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
274 aa  205  7e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
286 aa  205  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  44.74 
 
 
280 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  43.22 
 
 
279 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  39.41 
 
 
281 aa  203  2e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 
259 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  42.65 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
402 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0638  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  45.88 
 
 
298 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
289 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  39.05 
 
 
280 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  45.62 
 
 
271 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 
278 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  47.27 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  39.78 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  38.32 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  39.7 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  38.32 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
277 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  38.32 
 
 
280 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  38.32 
 
 
280 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  38.32 
 
 
280 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  38.32 
 
 
280 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  50 
 
 
435 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  38.52 
 
 
278 aa  197  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  45.85 
 
 
396 aa  197  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1911  dihydropteroate synthase  47.21 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  38.69 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  45.21 
 
 
368 aa  196  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  45.24 
 
 
436 aa  195  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
270 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 
298 aa  195  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  37.92 
 
 
376 aa  195  7e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2876  dihydropteroate synthase  52 
 
 
290 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0307138  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
302 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  37.59 
 
 
286 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  42.96 
 
 
393 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
284 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  37.97 
 
 
400 aa  193  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
279 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  43.33 
 
 
279 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 
267 aa  193  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>