More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4015 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  100 
 
 
283 aa  543  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  66.42 
 
 
275 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  66.79 
 
 
275 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  66.79 
 
 
275 aa  340  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  65.33 
 
 
270 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  62.5 
 
 
268 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  62.14 
 
 
280 aa  305  7e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  63.6 
 
 
261 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  60.82 
 
 
286 aa  277  1e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  58.76 
 
 
486 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  55.96 
 
 
300 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  62.5 
 
 
282 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  60.16 
 
 
291 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0561  dihydropteroate synthase  63.54 
 
 
290 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  57.3 
 
 
291 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  57.03 
 
 
283 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  54.07 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  58.33 
 
 
293 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  53.15 
 
 
314 aa  253  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  56.16 
 
 
302 aa  248  7e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  57.2 
 
 
285 aa  248  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0850  dihydropteroate synthase  63.74 
 
 
318 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  56.74 
 
 
351 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  59.66 
 
 
315 aa  242  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  54.38 
 
 
286 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  50.36 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  57.78 
 
 
296 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  59.77 
 
 
269 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  56.57 
 
 
309 aa  224  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  52.96 
 
 
304 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  50.92 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  45.71 
 
 
287 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  55.27 
 
 
311 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  52.81 
 
 
306 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  46.69 
 
 
285 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  54.48 
 
 
315 aa  206  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01260  Dihydropteroate synthase  53.16 
 
 
305 aa  204  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
280 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  39.26 
 
 
259 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  47.41 
 
 
281 aa  203  2e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  50.54 
 
 
311 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  43.07 
 
 
286 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  45.91 
 
 
283 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  38.52 
 
 
259 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  48.53 
 
 
271 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 
400 aa  198  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  45.39 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 
276 aa  195  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  48 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
274 aa  195  9e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  43.58 
 
 
280 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  43.58 
 
 
277 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  43.97 
 
 
277 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  43.58 
 
 
280 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.58 
 
 
280 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  43.58 
 
 
280 aa  192  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  43.58 
 
 
280 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
272 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  45.58 
 
 
289 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0638  dihydropteroate synthase  45.93 
 
 
288 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  43.58 
 
 
277 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
412 aa  192  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 
267 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  42.41 
 
 
286 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
291 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
277 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  48.52 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1911  dihydropteroate synthase  46.36 
 
 
268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 
294 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 
397 aa  189  5e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
279 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
277 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  44.24 
 
 
285 aa  189  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 
298 aa  188  8e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  44.83 
 
 
436 aa  188  9e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  38.13 
 
 
400 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0829  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
259 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.310722  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1841  dihydropteroate synthase  47.79 
 
 
368 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
298 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  40.79 
 
 
282 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  43.97 
 
 
393 aa  185  9e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  41.91 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  41.91 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  40.81 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  43.45 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  44.98 
 
 
413 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
297 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  42.02 
 
 
274 aa  183  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  44.89 
 
 
291 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09371  putative dihydropteroate synthase  35.53 
 
 
299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783824 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  45.94 
 
 
289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  50.19 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  39.85 
 
 
278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  41.9 
 
 
289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  48.44 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  41.31 
 
 
270 aa  182  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  40.44 
 
 
277 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 
283 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>