More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  100 
 
 
282 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  67.55 
 
 
261 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  61.65 
 
 
270 aa  315  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  61.62 
 
 
291 aa  311  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  62.41 
 
 
275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  62.41 
 
 
275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  62.03 
 
 
275 aa  309  4e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  63.04 
 
 
283 aa  308  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  64.59 
 
 
291 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  64.68 
 
 
286 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  60.9 
 
 
268 aa  305  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  58.91 
 
 
300 aa  301  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  62.22 
 
 
486 aa  295  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  60.38 
 
 
293 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  59.33 
 
 
280 aa  286  2e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  62.08 
 
 
291 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  57.35 
 
 
314 aa  281  9e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  62.35 
 
 
283 aa  277  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  59.27 
 
 
302 aa  275  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0850  dihydropteroate synthase  67.03 
 
 
318 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  61.4 
 
 
351 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  57.89 
 
 
286 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  60.49 
 
 
309 aa  265  7e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  58.11 
 
 
285 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  62.31 
 
 
296 aa  258  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  61.13 
 
 
315 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0561  dihydropteroate synthase  60.14 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  58.87 
 
 
315 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  54.55 
 
 
304 aa  245  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  53.09 
 
 
285 aa  245  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  60.08 
 
 
269 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  47.41 
 
 
287 aa  242  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  48.88 
 
 
286 aa  241  1e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 
280 aa  238  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  55.17 
 
 
306 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  52.55 
 
 
281 aa  234  9e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  54.85 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  48.94 
 
 
291 aa  233  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  50.92 
 
 
278 aa  232  5e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  44 
 
 
259 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  43.6 
 
 
259 aa  227  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  47.81 
 
 
278 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 
277 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01260  Dihydropteroate synthase  54.61 
 
 
305 aa  224  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
277 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
281 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  49.08 
 
 
291 aa  223  2e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
277 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
277 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
277 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  47.57 
 
 
277 aa  223  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  57.68 
 
 
311 aa  222  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
277 aa  222  7e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
284 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  49.07 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  48.22 
 
 
283 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  45.66 
 
 
280 aa  219  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  49.61 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 
279 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1075  dihydropteroate synthase  45.76 
 
 
282 aa  218  8.999999999999998e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0396  dihydropteroate synthase  53.85 
 
 
302 aa  218  1e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327356  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  48.52 
 
 
311 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  48.56 
 
 
271 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  43.19 
 
 
397 aa  217  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
274 aa  216  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 
258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  48.51 
 
 
277 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  45.67 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  45.74 
 
 
286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  48.67 
 
 
400 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 
298 aa  212  5.999999999999999e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 
280 aa  211  9e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  48.03 
 
 
436 aa  211  1e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 
376 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  47.58 
 
 
272 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
282 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
282 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
282 aa  210  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
282 aa  210  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
282 aa  210  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
282 aa  210  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0829  dihydropteroate synthase  48.62 
 
 
259 aa  210  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.310722  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
282 aa  210  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
277 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  44.19 
 
 
282 aa  210  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 
282 aa  210  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  45.22 
 
 
285 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
277 aa  209  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 
277 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  48.29 
 
 
258 aa  209  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 
280 aa  208  8e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  43.98 
 
 
277 aa  208  9e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  47.06 
 
 
294 aa  207  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 
282 aa  207  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  46.64 
 
 
280 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>