More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  100 
 
 
314 aa  616  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  56.04 
 
 
486 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  58.3 
 
 
291 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  54.23 
 
 
300 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  54.31 
 
 
270 aa  259  3e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  57.2 
 
 
261 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  51.46 
 
 
291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  54.36 
 
 
291 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  53.56 
 
 
275 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  56.18 
 
 
286 aa  248  9e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  53.56 
 
 
275 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  53.56 
 
 
275 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  54.24 
 
 
283 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  57.35 
 
 
282 aa  245  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  51.88 
 
 
268 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  57.81 
 
 
269 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  54.17 
 
 
293 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  53.87 
 
 
351 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  56.65 
 
 
285 aa  231  9e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  53.96 
 
 
302 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  51.09 
 
 
286 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  50.18 
 
 
285 aa  229  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  52.75 
 
 
304 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  52.24 
 
 
280 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  54.58 
 
 
283 aa  225  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  48.65 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  45.72 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  44.56 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
287 aa  219  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  53.16 
 
 
315 aa  219  6e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  54.7 
 
 
315 aa  218  8.999999999999998e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0561  dihydropteroate synthase  54.15 
 
 
290 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  49.26 
 
 
309 aa  215  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 
277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 
277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  44.16 
 
 
277 aa  212  7e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  45.79 
 
 
283 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  53.1 
 
 
283 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  44.56 
 
 
285 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 
278 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  42.56 
 
 
277 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 
279 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 
279 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  52.49 
 
 
283 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
280 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  42.55 
 
 
274 aa  206  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  41.98 
 
 
281 aa  206  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  45.93 
 
 
436 aa  205  8e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 
298 aa  205  8e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  45.83 
 
 
316 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 
277 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  41.01 
 
 
280 aa  203  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0850  dihydropteroate synthase  53.19 
 
 
318 aa  203  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 
286 aa  202  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 
291 aa  202  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  42.59 
 
 
280 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
277 aa  202  7e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  38.69 
 
 
283 aa  202  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  42.07 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  51.74 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  45.35 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  42.86 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  42.86 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  52.49 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  42.59 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  38.55 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  47.45 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 
277 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 
286 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0439  dihydropteroate synthase  47.78 
 
 
385 aa  199  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00392867  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  46.27 
 
 
291 aa  199  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  44.6 
 
 
311 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
412 aa  199  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  39.31 
 
 
298 aa  199  7e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 
277 aa  199  7e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  44.07 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  35.16 
 
 
273 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  45 
 
 
281 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  44.88 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  39.41 
 
 
259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0072  dihydropteroate synthase  45.9 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  41.33 
 
 
277 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  41.33 
 
 
277 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  38.55 
 
 
286 aa  195  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  40.59 
 
 
277 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  44.98 
 
 
276 aa  195  7e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  43.87 
 
 
817 aa  195  9e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 
277 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  42.08 
 
 
277 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
376 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  39.92 
 
 
259 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  41.33 
 
 
277 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 
277 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  54.21 
 
 
311 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2187  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
289 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.999142  normal  0.35895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>