More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5465 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  100 
 
 
286 aa  588  1e-167  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  52.55 
 
 
286 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  54.31 
 
 
272 aa  297  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0223  dihydropteroate synthase  55.6 
 
 
283 aa  293  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000034848  normal  0.0279297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 
273 aa  292  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3663  dihydropteroate synthase  52.24 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  48.19 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1589  dihydropteroate synthase  50.56 
 
 
281 aa  278  1e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.864925 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  45.13 
 
 
286 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
278 aa  238  9e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
400 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 
275 aa  236  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  45.22 
 
 
282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  44.85 
 
 
282 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 
282 aa  234  9e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 
282 aa  234  9e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  44.85 
 
 
282 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 
282 aa  234  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 
282 aa  234  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 
282 aa  234  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  44.85 
 
 
282 aa  234  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  46.39 
 
 
277 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  44.16 
 
 
277 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  44.16 
 
 
277 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 
282 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 
282 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 
282 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 
282 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 
277 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  43.01 
 
 
282 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 
277 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  44.7 
 
 
376 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  44.87 
 
 
277 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  42.59 
 
 
277 aa  223  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
277 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
277 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  43.28 
 
 
282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 
277 aa  222  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  43.38 
 
 
282 aa  220  1.9999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  42.34 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 
282 aa  218  7e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  45.04 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  44.07 
 
 
283 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
277 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  44.16 
 
 
283 aa  218  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 
277 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
277 aa  216  4e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
277 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 
311 aa  215  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
397 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  40.61 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  44.11 
 
 
275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  46.18 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
280 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  42.66 
 
 
290 aa  211  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  39.42 
 
 
276 aa  211  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 
283 aa  211  9e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  41.04 
 
 
278 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  41.57 
 
 
259 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  42.03 
 
 
279 aa  209  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
277 aa  208  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  42.96 
 
 
286 aa  208  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  44.07 
 
 
283 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.3 
 
 
280 aa  207  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 
277 aa  206  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  42.81 
 
 
298 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  41.24 
 
 
283 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 
283 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  43.66 
 
 
279 aa  205  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  39.44 
 
 
278 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  43.33 
 
 
283 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 
283 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  41.24 
 
 
283 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
283 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  43.92 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  40.89 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  43.63 
 
 
291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  40.53 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  44.81 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  43.32 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  38.55 
 
 
314 aa  195  6e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 
345 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
275 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  36.11 
 
 
294 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  38.85 
 
 
303 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 
281 aa  193  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  41.22 
 
 
278 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  40 
 
 
302 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  41.42 
 
 
345 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  40.38 
 
 
280 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>