More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32070 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  100 
 
 		 351 aa  666    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  72.86 
 
 		 315 aa  326  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  66.91 
 
 		 291 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  60.14 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  66.06 
 
 		 285 aa  311  6.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  66.27 
 
 		 283 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  71.75 
 
 		 315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  62.78 
 
 		 286 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  57.58 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  62.21 
 
 		 486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  63.02 
 
 		 286 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  58.19 
 
 		 302 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  62.03 
 
 		 282 aa  272  6e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  59.7 
 
 		 275 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  59.7 
 
 		 275 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  59.32 
 
 		 275 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  56.23 
 
 		 270 aa  266  5e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  53.87 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  67.07 
 
 		 269 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  61.09 
 
 		 309 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  56.23 
 
 		 285 aa  258  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  61.83 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  55.85 
 
 		 293 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  62.45 
 
 		 261 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  51.06 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  55.97 
 
 		 280 aa  249  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  58.04 
 
 		 283 aa  248  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  55.93 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  55.43 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  60.52 
 
 		 296 aa  242  6e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0850  dihydropteroate synthase  62.3 
 
 		 318 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01260  Dihydropteroate synthase  59.7 
 
 		 305 aa  235  7e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 		 280 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 		 285 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  55.73 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  54.58 
 
 		 306 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  45.66 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  45.66 
 
 		 279 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 277 aa  222  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 277 aa  222  9e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0561  dihydropteroate synthase  55.6 
 
 		 290 aa  222  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  45.95 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  47.15 
 
 		 284 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  45.28 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  39.7 
 
 		 281 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  45.25 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  46.99 
 
 		 277 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  46.39 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  46.39 
 
 		 277 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  40.58 
 
 		 286 aa  215  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  41.3 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  46.39 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 		 277 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  46.39 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  43.77 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  45.22 
 
 		 277 aa  214  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  43.49 
 
 		 282 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  40.94 
 
 		 280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  44.24 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 		 283 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  48.94 
 
 		 301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  41.3 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  43.49 
 
 		 282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 		 282 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  40.58 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  40.58 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  40.58 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  40.58 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  40.58 
 
 		 277 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  54.55 
 
 		 311 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 		 400 aa  209  4e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 394 aa  209  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 282 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  44.49 
 
 		 279 aa  209  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 282 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 282 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 282 aa  209  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  48.18 
 
 		 278 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  43.61 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 		 282 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  43.82 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  46.86 
 
 		 302 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  45.66 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  48 
 
 		 298 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  40.58 
 
 		 277 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  39.02 
 
 		 259 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>