More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0618 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  100 
 
 
286 aa  555  1e-157  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  65.79 
 
 
486 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  62.92 
 
 
300 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  67.06 
 
 
283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  66.67 
 
 
291 aa  300  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  59.04 
 
 
291 aa  298  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  63.12 
 
 
282 aa  298  9e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  65.04 
 
 
291 aa  298  1e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  59.49 
 
 
293 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  60.85 
 
 
280 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  58.78 
 
 
275 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  59.16 
 
 
275 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  59.16 
 
 
275 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  57.95 
 
 
270 aa  276  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  57.09 
 
 
268 aa  275  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  60.78 
 
 
283 aa  271  6e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  61.13 
 
 
261 aa  269  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  56.18 
 
 
314 aa  265  7e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  61.94 
 
 
302 aa  264  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  63.02 
 
 
351 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  67.07 
 
 
269 aa  258  8e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  55.44 
 
 
304 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  60.67 
 
 
309 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  59.77 
 
 
286 aa  254  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  59.46 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  61.99 
 
 
296 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  60.61 
 
 
315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  61.13 
 
 
311 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  54.04 
 
 
306 aa  235  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0850  dihydropteroate synthase  66.04 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  59.63 
 
 
315 aa  228  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 
277 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 
277 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  46.13 
 
 
287 aa  223  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
277 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 
284 aa  222  4e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  50.54 
 
 
311 aa  222  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01260  Dihydropteroate synthase  56.65 
 
 
305 aa  221  7e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  44.96 
 
 
274 aa  221  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  52.08 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2303  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933807  normal  0.841212 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  47.08 
 
 
291 aa  219  5e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  48.31 
 
 
277 aa  218  6e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  40.98 
 
 
397 aa  215  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  45.11 
 
 
277 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  48.56 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0561  dihydropteroate synthase  54.29 
 
 
290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  44.74 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  47.21 
 
 
283 aa  212  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  50.18 
 
 
276 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  40.57 
 
 
277 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 
271 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  45.25 
 
 
279 aa  210  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
277 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  45.85 
 
 
279 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  54.22 
 
 
283 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 
277 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  45.56 
 
 
277 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
278 aa  208  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  42.37 
 
 
281 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  41.76 
 
 
286 aa  207  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  44.98 
 
 
276 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 
283 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  48.35 
 
 
298 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 
277 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
291 aa  206  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 
277 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.65 
 
 
280 aa  206  4e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2337  dihydropteroate synthase  54.65 
 
 
280 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.968107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
286 aa  205  6e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  46.84 
 
 
283 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  42.21 
 
 
280 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1737  dihydropteroate synthase  42.18 
 
 
298 aa  203  3e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.183796  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  45.72 
 
 
278 aa  203  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 
278 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
277 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  44.94 
 
 
277 aa  202  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.4 
 
 
280 aa  202  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  55.02 
 
 
283 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  44.32 
 
 
303 aa  202  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  43.43 
 
 
285 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  53.01 
 
 
283 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  43.73 
 
 
259 aa  202  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2184  dihydropteroate synthase  52.43 
 
 
284 aa  201  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
287 aa  201  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  44 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  44 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  44 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  44 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  44 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  44 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  44 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  44 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  44 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>