More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0638 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0638  dihydropteroate synthase  100 
 
 
288 aa  569  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  50 
 
 
291 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4972  dihydropteroate synthase  46.79 
 
 
300 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450509  normal  0.898132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  46.07 
 
 
270 aa  208  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9173  Dihydropteroate synthase  48.81 
 
 
283 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0315  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 
261 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457571  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3445  dihydropteroate synthase  48.41 
 
 
291 aa  203  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.180221  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  48.84 
 
 
486 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5370  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 
268 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0168  dihydropteroate synthase  50.2 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00447644  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4732  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 
291 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.0090044  decreased coverage  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  48.02 
 
 
315 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  39.56 
 
 
291 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
275 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
275 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  45.86 
 
 
275 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0153  dihydropteroate synthase  46.24 
 
 
311 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2102  dihydropteroate synthase  48.47 
 
 
285 aa  191  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2893  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 
302 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8423  dihydropteroate synthase  47.01 
 
 
293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0207  dihydropteroate synthase  47.39 
 
 
309 aa  189  5e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0715568 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24760  Dihydropteroate synthase  44.79 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0446  dihydropteroate synthase  48.09 
 
 
286 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.654921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35630  Dihydropteroate synthase  47.53 
 
 
282 aa  188  8e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.199467  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0618  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 
286 aa  188  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32070  Dihydropteroate synthase  48.11 
 
 
351 aa  188  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  41.54 
 
 
267 aa  186  4e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4407  dihydropteroate synthase  51.13 
 
 
311 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  43.3 
 
 
294 aa  186  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  41.52 
 
 
436 aa  185  7e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  40.37 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12820  Dihydropteroate synthase  45.35 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755879  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  44.7 
 
 
435 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2985  dihydropteroate synthase  48.24 
 
 
315 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167684  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10631  putative dihydropteroate synthase  36.8 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0581099 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0549  dihydropteroate synthase  38.76 
 
 
267 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0536  dihydropteroate synthase  38.76 
 
 
267 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0712347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  38.91 
 
 
269 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  38.91 
 
 
269 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4015  dihydropteroate synthase  45.49 
 
 
283 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  39.77 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  39.77 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  39.77 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  39.77 
 
 
280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 
277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0540  dihydropteroate synthase  47.35 
 
 
296 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0316  dihydropteroate synthase  46.21 
 
 
306 aa  179  4e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  39.77 
 
 
277 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0153  dihydropteroate synthase  38.55 
 
 
272 aa  179  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.77759  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0381  dihydropteroate synthase  36 
 
 
259 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0970  dihydropteroate synthase  37.26 
 
 
284 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  37.07 
 
 
270 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
394 aa  178  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  39.38 
 
 
280 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  36.58 
 
 
397 aa  178  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  45.78 
 
 
283 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  39.6 
 
 
279 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  46.82 
 
 
280 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  39.6 
 
 
279 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  39.6 
 
 
280 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1851  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 
291 aa  176  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  37.35 
 
 
376 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  44.18 
 
 
437 aa  176  5e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 
276 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  39.38 
 
 
277 aa  175  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2371  dihydropteroate synthase  44.98 
 
 
283 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  37.84 
 
 
274 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  39.38 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  36.47 
 
 
356 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1496  dihydropteroate synthase  45.78 
 
 
283 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  38.22 
 
 
286 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  41.31 
 
 
279 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  39.38 
 
 
277 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  41.31 
 
 
279 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  41.73 
 
 
400 aa  170  3e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  38.91 
 
 
393 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  43.31 
 
 
413 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 
286 aa  169  7e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  40.94 
 
 
298 aa  168  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  39.92 
 
 
301 aa  168  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1099  dihydropteroate synthase  42.17 
 
 
396 aa  168  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  40.93 
 
 
311 aa  168  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  39.69 
 
 
272 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10401  putative dihydropteroate synthase  35.36 
 
 
281 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
302 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  39.06 
 
 
303 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  42.04 
 
 
813 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  35.58 
 
 
412 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  34.62 
 
 
400 aa  166  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  35.94 
 
 
281 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  40.47 
 
 
285 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  39.04 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  41.9 
 
 
291 aa  165  9e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10401  putative dihydropteroate synthase  35.11 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  38.43 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  42.23 
 
 
817 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  38.25 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4503  dihydropteroate synthase  45.82 
 
 
269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2726  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>