More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0153 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0153  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 272 aa  562  1.0000000000000001e-159  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.77759  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0536  dihydropteroate synthase  75.74 
 
 		 267 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0712347  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0549  dihydropteroate synthase  75.74 
 
 		 267 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  48.08 
 
 		 283 aa  228  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  46.54 
 
 		 285 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 		 269 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  48.46 
 
 		 393 aa  222  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1115  dihydropteroate synthase  43.03 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  47.31 
 
 		 270 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  45.38 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  45.38 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  46.92 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 286 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 280 aa  210  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  46.82 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  45.98 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 		 274 aa  208  6e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  46.12 
 
 		 402 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 		 274 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 		 396 aa  194  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  41.53 
 
 		 279 aa  189  5e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  42.13 
 
 		 287 aa  188  7e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  42.07 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  43.87 
 
 		 413 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1349  dihydropteroate synthase  41.09 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  40.52 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02190  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  44 
 
 		 436 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.653512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  40.3 
 
 		 294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  38.78 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  39.55 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  37.72 
 
 		 412 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 		 278 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1603  dihydropteroate synthase  39.69 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0216733  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  41.51 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  41.11 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  39.15 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  40.32 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1485  dihydropteroate synthase  39.69 
 
 		 284 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0106007  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  40.51 
 
 		 311 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6218  dihydropteroate synthase  40.78 
 
 		 291 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  40.31 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  40.31 
 
 		 279 aa  175  8e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02040  dihydropteroate synthase/2-amino-4-hydroxy-6- hydroxymethyldihydropteridine pyrophosphokinase  42.4 
 
 		 437 aa  175  8e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.439643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 		 813 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  37.9 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1971  dihydropteroate synthase  38.38 
 
 		 289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 		 295 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1412  dihydropteroate synthase  44.76 
 
 		 278 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  36.67 
 
 		 289 aa  171  9e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  36.54 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  38.35 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  40.62 
 
 		 400 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0629  dihydropteroate synthase  40.85 
 
 		 315 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0277485  normal  0.623209 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4297  dihydropteroate synthase  40.55 
 
 		 486 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.589552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4768  dihydropteroate synthase  40.47 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913998  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4854  dihydropteroate synthase  40.47 
 
 		 275 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  37.55 
 
 		 298 aa  168  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5154  dihydropteroate synthase  40.47 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  37.25 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2895  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 435 aa  167  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0638  dihydropteroate synthase  38.55 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  36.58 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  36.57 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  39.56 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  40.64 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13640  dihydropteroate synthase 1 folp  39.92 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.313488  hitchhiker  0.00155849 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  41.04 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  40.64 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 		 282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2076  dihydropteroate synthase  39.69 
 
 		 285 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.495698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  40.24 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1418  dihydropteroate synthase  38.28 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28051  normal  0.410951 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  37.89 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  36.43 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  38.49 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  39.22 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  37.7 
 
 		 274 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  39.04 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  36.47 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  39.2 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>