More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3533 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3533  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 288 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139072  normal  0.316671 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1932  dihydropteroate synthase  87.54 
 
 		 392 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.36752  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  82.58 
 
 		 285 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  75.37 
 
 		 292 aa  401  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  75.95 
 
 		 294 aa  391  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1765  dihydropteroate synthase  72.99 
 
 		 285 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.270074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3026  dihydropteroate synthase  70.21 
 
 		 285 aa  353  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0147  dihydropteroate synthase  53.15 
 
 		 257 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0513  dihydropteroate synthase  56.47 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.884922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5758  dihydropteroate synthase  56.86 
 
 		 295 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.425757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1814  dihydropteroate synthase  56.86 
 
 		 289 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.690503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5983  dihydropteroate synthase  56.86 
 
 		 279 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0523591  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1766  dihydropteroate synthase  58.82 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.202084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2150  dihydropteroate synthase  56.37 
 
 		 289 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  48.22 
 
 		 274 aa  236  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  48.64 
 
 		 285 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  48.59 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  47.67 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  47.62 
 
 		 393 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1581  dihydropteroate synthase  51.54 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.239571 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 		 277 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 394 aa  215  7e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 		 397 aa  215  8e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  45.06 
 
 		 286 aa  214  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  43.27 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  43.27 
 
 		 269 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  45.06 
 
 		 280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1330  dihydropteroate synthase  43.08 
 
 		 274 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144104  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 		 286 aa  211  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.66 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  44.66 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 277 aa  211  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  44.66 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  45.52 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  45.38 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  47.04 
 
 		 396 aa  206  4e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  47.24 
 
 		 394 aa  206  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 		 407 aa  205  6e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  46.72 
 
 		 272 aa  205  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  46.48 
 
 		 279 aa  205  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  43.36 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  46.77 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  46.15 
 
 		 400 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  44.03 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 282 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  43.25 
 
 		 399 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0205  dihydropteroate synthase  48.82 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  44.4 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  43.48 
 
 		 402 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  47.27 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  44.74 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  45.17 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  42.97 
 
 		 279 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 		 281 aa  196  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  45 
 
 		 290 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  42.32 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2115  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 		 264 aa  195  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  45.63 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0060  dihydropteroate synthase  45.31 
 
 		 298 aa  193  2e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.404361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  44.62 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  43.24 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  43.68 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1534  dihydropteroate synthase  43.3 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  43.94 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  45.25 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 		 282 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2459  dihydropteroate synthase  46.83 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  44.19 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  45.39 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2183  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0156937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  44.12 
 
 		 277 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  44.14 
 
 		 287 aa  192  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  42.11 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  42.22 
 
 		 284 aa  191  9e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>