More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0223 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0223  dihydropteroate synthase  100 
 
 
283 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000034848  normal  0.0279297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  59.86 
 
 
286 aa  341  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  54.31 
 
 
273 aa  308  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  55.6 
 
 
286 aa  293  3e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3663  dihydropteroate synthase  54.65 
 
 
288 aa  291  7e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  48.73 
 
 
283 aa  289  5.0000000000000004e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  50.37 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1589  dihydropteroate synthase  50.55 
 
 
281 aa  276  3e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.864925 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  51.65 
 
 
272 aa  271  7e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  46.27 
 
 
275 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  42.18 
 
 
400 aa  226  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  41.89 
 
 
266 aa  222  6e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  42.66 
 
 
311 aa  215  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  42.15 
 
 
278 aa  215  7e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 
279 aa  215  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  43.23 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  42.07 
 
 
277 aa  212  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  41.44 
 
 
278 aa  211  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
274 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  42.86 
 
 
277 aa  210  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  41.64 
 
 
282 aa  210  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 
376 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  44.79 
 
 
281 aa  206  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  41.37 
 
 
279 aa  206  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  39.92 
 
 
278 aa  205  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  44.24 
 
 
280 aa  205  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 
285 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  41.79 
 
 
277 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  42.64 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  42.64 
 
 
282 aa  203  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
282 aa  202  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  42.54 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
282 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  42.26 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  41.04 
 
 
277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  40.86 
 
 
277 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  45.75 
 
 
287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  44.78 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  41.13 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  42.34 
 
 
399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  38.91 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  41.13 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  41.42 
 
 
277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  43.66 
 
 
283 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09051  putative dihydropteroate synthase  38.43 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
279 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  43.53 
 
 
279 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  42.8 
 
 
277 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  41.61 
 
 
291 aa  194  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  41.04 
 
 
277 aa  193  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  43.65 
 
 
400 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 
283 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  40.59 
 
 
272 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  41.82 
 
 
277 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1826  dihydropteroate synthase  41.96 
 
 
281 aa  193  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  41.04 
 
 
280 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  40.08 
 
 
277 aa  193  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  41.82 
 
 
280 aa  192  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  41 
 
 
286 aa  192  4e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  44.03 
 
 
283 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  42.18 
 
 
277 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  41.82 
 
 
277 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  44.74 
 
 
283 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 
284 aa  192  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  41.45 
 
 
286 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1969  dihydropteroate synthase  41.99 
 
 
285 aa  192  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000758372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  41.82 
 
 
280 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  41.82 
 
 
280 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  41.82 
 
 
280 aa  192  7e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  41.82 
 
 
280 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  39.85 
 
 
276 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  41.82 
 
 
277 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  46.06 
 
 
290 aa  191  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
277 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  43.66 
 
 
283 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10401  putative dihydropteroate synthase  38.65 
 
 
281 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  39.64 
 
 
356 aa  190  2e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  41.42 
 
 
277 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  42.38 
 
 
277 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0536  dihydropteroate synthase  40.66 
 
 
303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0325452  unclonable  0.00000000124281 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10401  putative dihydropteroate synthase  37.6 
 
 
261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  44.15 
 
 
283 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  40.23 
 
 
302 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  40.3 
 
 
277 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  40 
 
 
277 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  43.18 
 
 
290 aa  188  7e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  39.22 
 
 
397 aa  188  8e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  41.37 
 
 
275 aa  188  8e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>