More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1848 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  100 
 
 		 371 aa  748    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  74.39 
 
 		 370 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  72.13 
 
 		 371 aa  555  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  76.75 
 
 		 370 aa  554  1e-156  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  66.03 
 
 		 370 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  58.31 
 
 		 364 aa  434  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  53.83 
 
 		 363 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  51.77 
 
 		 367 aa  392  1e-108  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  52.32 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  52.04 
 
 		 369 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  52.32 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  52.59 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  49.86 
 
 		 365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  48.08 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  45.79 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  44.07 
 
 		 369 aa  297  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  42.62 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  45.5 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  42.55 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  44.21 
 
 		 407 aa  284  1.0000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  43.94 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  42.13 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  41.3 
 
 		 368 aa  281  2e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  43.38 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  44.19 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  40.96 
 
 		 373 aa  272  6e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  42.16 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  40.68 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  42.86 
 
 		 378 aa  269  5e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  41.73 
 
 		 367 aa  269  7e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  30.77 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  30.29 
 
 		 377 aa  149  8e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  27.68 
 
 		 389 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  28.27 
 
 		 387 aa  138  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  30.54 
 
 		 351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  28.8 
 
 		 380 aa  129  7.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  27.49 
 
 		 387 aa  125  9e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  28.3 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  27.91 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  27.45 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  29.82 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  25.28 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  43.33 
 
 		 352 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  46.51 
 
 		 348 aa  75.5  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  32 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  32 
 
 		 330 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  45.78 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  31.79 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  36.46 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  27.31 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  39.09 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.27 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 334 aa  67  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  34.55 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.24 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  42.22 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  24.77 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.24 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 353 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  36.45 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.78 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.76 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  37 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  31.69 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  30.64 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  42.22 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  40.2 
 
 		 337 aa  65.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0532  GTP-binding protein YchF  39.62 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.9 
 
 		 452 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  44.44 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  29.66 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  40 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.53 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  35.85 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8476  GTP-binding protein YchF  36.45 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  36.94 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  36.44 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.11 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.62 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  32.73 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.17 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  36.89 
 
 		 337 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  37.93 
 
 		 560 aa  63.5  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.91 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  36.78 
 
 		 519 aa  63.2  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.08 
 
 		 463 aa  63.2  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  37.19 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  35.54 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  31.82 
 
 		 424 aa  63.2  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  36.29 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  36.78 
 
 		 509 aa  62.8  0.000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3062  GTP-binding protein YchF  36.45 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  37.93 
 
 		 563 aa  62.4  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  41.86 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.29 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0910  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  25.43 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0422609  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  41.11 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  40.48 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  40.7 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>