More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0446 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 
328 aa  671    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  58.39 
 
 
328 aa  352  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  56.39 
 
 
327 aa  331  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  53.95 
 
 
307 aa  315  5e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  49.83 
 
 
311 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  48.82 
 
 
311 aa  289  4e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  48.82 
 
 
311 aa  276  3e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  46.88 
 
 
309 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  47.14 
 
 
307 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  47.74 
 
 
285 aa  255  7e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  44.3 
 
 
308 aa  252  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  43.33 
 
 
307 aa  249  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  45.58 
 
 
315 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  46.28 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  36.82 
 
 
314 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  43.55 
 
 
285 aa  202  5e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  38.54 
 
 
304 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  33.44 
 
 
315 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  38.97 
 
 
296 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  36.63 
 
 
313 aa  176  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  35.42 
 
 
308 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  36.71 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  38.01 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  38.28 
 
 
302 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  36.79 
 
 
317 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  38.52 
 
 
304 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  36.6 
 
 
304 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  38.1 
 
 
306 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  33.9 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  34.81 
 
 
312 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  34.33 
 
 
300 aa  165  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  36.08 
 
 
295 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 
295 aa  162  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  36.46 
 
 
295 aa  162  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  33.01 
 
 
346 aa  161  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  36.36 
 
 
300 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  32.77 
 
 
317 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 
305 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 
315 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  33.56 
 
 
315 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  32.41 
 
 
302 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  32.35 
 
 
476 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  36.16 
 
 
295 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  35.09 
 
 
376 aa  155  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  32.33 
 
 
330 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  32.88 
 
 
293 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  36.05 
 
 
295 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  34.6 
 
 
295 aa  151  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  33.11 
 
 
328 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  34.6 
 
 
293 aa  149  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  36.49 
 
 
302 aa  149  7e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3300  iron and zinc efflux system protein  31.01 
 
 
318 aa  149  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.831799  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  36.11 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1379  cation diffusion facilitator family transporter  31.37 
 
 
481 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.892961  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0846  cation diffusion facilitator family transporter  35.56 
 
 
459 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034385  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  29.67 
 
 
331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  34.03 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  32.89 
 
 
315 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  37.13 
 
 
302 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  35.29 
 
 
314 aa  145  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  30.03 
 
 
299 aa  145  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4937  cation efflux protein  31.17 
 
 
298 aa  143  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  37.09 
 
 
302 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  37.09 
 
 
302 aa  142  7e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.13 
 
 
312 aa  142  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2628  cation efflux protein  30.77 
 
 
325 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0974  cation diffusion facilitator family transporter  31.86 
 
 
466 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12610  putative transporter  33.57 
 
 
298 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.686969  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  28.38 
 
 
332 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0847  cation efflux protein  27.3 
 
 
297 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3435  cation diffusion facilitator family transporter  32.99 
 
 
478 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0253813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  29.97 
 
 
301 aa  137  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1146  putative transporter  32.86 
 
 
298 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0745  cation diffusion facilitator family transporter  32.65 
 
 
460 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  31.62 
 
 
309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2019  cation diffusion facilitator family transporter  33.33 
 
 
459 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.40781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  31.85 
 
 
316 aa  136  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  34.83 
 
 
295 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  30.36 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  29.03 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0137  ferrous iron efflux protein F  29.9 
 
 
300 aa  134  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  32.2 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0393  cation diffusion facilitator family transporter  31.73 
 
 
483 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.38697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0047  cation diffusion facilitator family transporter  29.53 
 
 
325 aa  132  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4774  cation diffusion facilitator family transporter  30.46 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00437993 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0550  cation efflux protein  33.22 
 
 
459 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.247369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2245  cation diffusion facilitator family transporter  33.83 
 
 
483 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0491  cation diffusion facilitator family transporter  28.76 
 
 
354 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0566502 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  28.47 
 
 
295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4650  cation diffusion facilitator family transporter  30.77 
 
 
290 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.188299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0646  cation diffusion facilitator family transporter  30.21 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186266  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  34.35 
 
 
295 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  27.87 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2090  cation efflux family protein  32.56 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  29.39 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002221  cobalt-zinc-cadmium resistance protein  28.47 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000518265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0484  cation efflux protein  31.23 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  32.09 
 
 
312 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>