55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0125 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 178 aa  358  2e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.67 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  46.45 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.03 
 
 		 390 aa  82.4  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.18 
 
 		 958 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.15 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.5 
 
 		 1412 aa  71.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.75 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1700  metalloenzyme domain-containing protein  31.94 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.973288 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.91 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1094 aa  64.7  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  38.58 
 
 		 431 aa  64.7  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.9 
 
 		 1148 aa  62  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.81 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.71 
 
 		 510 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.99 
 
 		 400 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.85 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.95 
 
 		 1041 aa  56.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.95 
 
 		 524 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.71 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.58 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.55 
 
 		 1438 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.67 
 
 		 1139 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.1 
 
 		 831 aa  51.6  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.23 
 
 		 192 aa  51.2  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.67 
 
 		 490 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  44.87 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.48 
 
 		 1343 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  32.14 
 
 		 644 aa  48.5  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.67 
 
 		 200 aa  48.1  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.59 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.11 
 
 		 1181 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  29.29 
 
 		 517 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.97 
 
 		 321 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.3 
 
 		 323 aa  45.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.66 
 
 		 370 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.79 
 
 		 1194 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_196  PBS lyase heat-like repeat domain protein  30.77 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.69738  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1224 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  34.48 
 
 		 1137 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  31.43 
 
 		 886 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  37.35 
 
 		 1133 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.94 
 
 		 464 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2476  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.98 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  27.11 
 
 		 299 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  31.15 
 
 		 546 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.32 
 
 		 408 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 		 313 aa  42  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  27.56 
 
 		 959 aa  41.6  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.75 
 
 		 321 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  32.56 
 
 		 286 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0131  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.51 
 
 		 547 aa  41.2  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000220266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  41.18 
 
 		 483 aa  41.2  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0219  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.91 
 
 		 164 aa  40.8  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.25 
 
 		 501 aa  40.8  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>