29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3324 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3324  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  651    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0125921  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  36.63 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  32.49 
 
 
675 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  30.52 
 
 
971 aa  124  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  32.77 
 
 
938 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  33.97 
 
 
713 aa  119  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  31.27 
 
 
374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  32.21 
 
 
669 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  29.55 
 
 
960 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  31.58 
 
 
379 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  29 
 
 
1001 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  31.23 
 
 
728 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  31.46 
 
 
560 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  32.74 
 
 
581 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  29.01 
 
 
819 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  29.21 
 
 
685 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  32.58 
 
 
658 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  27.75 
 
 
329 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  27.6 
 
 
679 aa  85.9  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  28.12 
 
 
771 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  22.87 
 
 
815 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  30.15 
 
 
448 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  26.73 
 
 
996 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  23.99 
 
 
1202 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  31.25 
 
 
1361 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  25.51 
 
 
403 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal 
 
 
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NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  19.49 
 
 
769 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  22.81 
 
 
1279 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
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NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  24.26 
 
 
171 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
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