47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0229 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0229  KAP P-loop domain-containing protein  100 
 
 
735 aa  1499    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471102  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0090  hypothetical protein  22.8 
 
 
706 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0396414  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2922  P-loop ATPase-like protein  28.81 
 
 
715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.182539 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5211  KAP P-loop domain-containing protein  29.69 
 
 
419 aa  114  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1014  P-loop ATPase  26.53 
 
 
315 aa  108  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.287262  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0010  KAP P-loop domain-containing protein  25.43 
 
 
728 aa  101  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154725 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001492  hypothetical protein  21.3 
 
 
758 aa  100  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.199722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3890  KAP P-loop domain protein  27.37 
 
 
706 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.0371093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4676  hypothetical protein  24.34 
 
 
736 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1598  KAP P-loop domain protein  26.57 
 
 
749 aa  99  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0025  KAP family P-loop domain protein  25.1 
 
 
884 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.046413 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1639  KAP P-loop domain-containing protein  22.22 
 
 
862 aa  85.9  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3386  hypothetical protein  24.56 
 
 
784 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256029  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2126  KAP P-loop domain-containing protein  25.11 
 
 
945 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28360  KAP family P-loop domain protein  26.18 
 
 
564 aa  72.8  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.143031 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0128  KAP P-loop domain protein  24.03 
 
 
471 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0689933  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0561  hypothetical protein  23.05 
 
 
577 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2881  KAP P-loop domain-containing protein  25.7 
 
 
671 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.660206  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2072  KAP P-loop  23.08 
 
 
997 aa  61.2  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.285295 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4815  KAP P-loop domain-containing protein  21.79 
 
 
623 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678803  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2164  KAP P-loop  25.74 
 
 
622 aa  58.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0661  ATPase  23.73 
 
 
615 aa  57.4  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204839  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5045  KAP P-loop domain protein  25.68 
 
 
1093 aa  54.7  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2638  KAP P-loop domain-containing protein  24.37 
 
 
459 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0998856 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1936  hypothetical protein  21.62 
 
 
978 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000106944 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1445  KAP P-loop domain protein  23.87 
 
 
461 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4250  KAP P-loop domain-containing protein  25.61 
 
 
594 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235835 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1051  KAP P-loop domain-containing protein  21.32 
 
 
672 aa  51.6  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6139  KAP P-loop domain-containing protein  22.09 
 
 
591 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3737  KAP P-loop  23.4 
 
 
444 aa  50.8  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.607075  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5210  hypothetical protein  22.97 
 
 
328 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3760  KAP P-loop domain-containing protein  24.79 
 
 
542 aa  49.3  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0432517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0414  KAP P-loop domain-containing protein  23.05 
 
 
565 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4923  hypothetical protein  19.31 
 
 
976 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.668191  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3681  KAP P-loop domain-containing protein  25.52 
 
 
488 aa  48.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0472  hypothetical protein  22.73 
 
 
510 aa  47.8  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0936  KAP P-loop domain protein  23.66 
 
 
647 aa  47.8  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5213  KAP P-loop domain-containing protein  20.21 
 
 
628 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.125841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5061  KAP P-loop domain-containing protein  20.21 
 
 
628 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3155  KAP P-loop  20.21 
 
 
628 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4058  KAP P-loop domain-containing protein  23.24 
 
 
506 aa  47  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0078  KAP P-loop domain-containing protein  21.3 
 
 
509 aa  46.6  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0601067  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3525  KAP P-loop domain-containing protein  21.93 
 
 
489 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3357  KAP P-loop domain-containing protein  21.54 
 
 
463 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2930  KAP P-loop domain-containing protein  21.54 
 
 
463 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.275131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0333  KAP P-loop domain-containing protein  23.34 
 
 
571 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2211  KAP P-loop  22.14 
 
 
650 aa  45.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>