More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2733 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  100 
 
 
237 aa  476  1e-133  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  34.12 
 
 
227 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  35.41 
 
 
219 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  34.97 
 
 
235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  33.49 
 
 
217 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
222 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.68 
 
 
235 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.19 
 
 
219 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.58 
 
 
217 aa  101  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  35.75 
 
 
271 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  34.64 
 
 
216 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.85 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.32 
 
 
227 aa  99.4  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  32.8 
 
 
221 aa  99  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1752  HAD family hydrolase  36.32 
 
 
232 aa  99  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  36.71 
 
 
229 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  33.04 
 
 
225 aa  98.2  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  32.5 
 
 
728 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 
256 aa  97.8  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  35.08 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1550  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.89 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.38 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0056  HAD family hydrolase  32.14 
 
 
226 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.27 
 
 
217 aa  95.1  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5006  HAD family hydrolase  35.02 
 
 
229 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 
238 aa  94  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  35.96 
 
 
223 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06771  phosphatase/phosphohexomutase  32.59 
 
 
226 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3307  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.21 
 
 
735 aa  93.2  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.081208  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  35.29 
 
 
226 aa  93.2  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
216 aa  92.4  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  29.73 
 
 
227 aa  92.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  32.62 
 
 
221 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  33.15 
 
 
219 aa  92  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  30.99 
 
 
220 aa  91.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  29.11 
 
 
220 aa  91.7  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  29.22 
 
 
456 aa  90.5  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.48 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  34.54 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1516  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  30.92 
 
 
707 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  32.88 
 
 
226 aa  90.1  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  33.51 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.17 
 
 
202 aa  90.1  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.26 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  34.95 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  31.1 
 
 
714 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  27.32 
 
 
226 aa  89.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.65 
 
 
207 aa  89.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  32.78 
 
 
188 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  32.78 
 
 
188 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  32.78 
 
 
188 aa  89.4  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  31.94 
 
 
707 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18961  phosphatase/phosphohexomutase  35.64 
 
 
225 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.452816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.59 
 
 
233 aa  89  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
710 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0820  HAD family hydrolase  26.61 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.420721  hitchhiker  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.02 
 
 
221 aa  87  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  29.22 
 
 
456 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
221 aa  87  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  29.47 
 
 
214 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  32.22 
 
 
188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  32.22 
 
 
188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  32.22 
 
 
188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  32.22 
 
 
188 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  30.27 
 
 
396 aa  85.9  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.88 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3186  fructose-1-phosphatase  32.78 
 
 
187 aa  85.9  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.71 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.99 
 
 
226 aa  85.9  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.22 
 
 
188 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2970  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
269 aa  85.9  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00804181  decreased coverage  0.0000706363 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25290  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.89 
 
 
244 aa  85.5  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0218735  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00226  hypothetical phosphatase/phosphohexomutase  27.32 
 
 
194 aa  85.5  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.05 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02312  putative unknown enzyme  32.29 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00322256  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.45 
 
 
231 aa  85.5  7e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  31.34 
 
 
219 aa  85.5  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3005  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0313059  hitchhiker  0.0000277628 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3129  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  85.1  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000901286  normal  0.0148605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.86 
 
 
217 aa  85.1  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  28.04 
 
 
216 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5452  HAD-superfamily hydrolase  33.98 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  29.35 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0336  HAD-superfamily hydrolase  33.05 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  31.69 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  32.76 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  32.76 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  33.96 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  32.76 
 
 
188 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0634  HAD-superfamily hydrolase  33.05 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.535941  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0082  HAD family hydrolase  33.05 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0196618  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2468  HAD-superfamily hydrolase  33.05 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273983  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.75 
 
 
213 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0674  phosphatase  26.85 
 
 
215 aa  84  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  26.32 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>