152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2701 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  100 
 
 		 253 aa  498  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  38.46 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  32.41 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  27.92 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  31.28 
 
 		 271 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.35 
 
 		 270 aa  92.8  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  29.69 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  28.69 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.56 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  28.69 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  25.31 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  30.67 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  23.92 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  30.12 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  27.97 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  29.87 
 
 		 166 aa  64.7  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  30.3 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  27.47 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  29.62 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.48 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  28.1 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  28.39 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  24.89 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  28.03 
 
 		 156 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  31.54 
 
 		 156 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  30.77 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  28.97 
 
 		 156 aa  53.1  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.17 
 
 		 143 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.17 
 
 		 143 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 		 156 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 		 156 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  29.53 
 
 		 156 aa  52.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  31.03 
 
 		 156 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  30.15 
 
 		 181 aa  52  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.34 
 
 		 156 aa  52  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  30.34 
 
 		 156 aa  52  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  27.5 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  29.17 
 
 		 164 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  28.19 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  28.81 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3175  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  38.89 
 
 		 141 aa  51.2  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.07 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  28.86 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2202  F0F1 ATP synthase subunit B'  30.56 
 
 		 161 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.024698  normal  0.231537 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl111  ATP synthase subunit B  22.08 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  29.7 
 
 		 156 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2760  ATP synthase F1, delta subunit  34.88 
 
 		 187 aa  48.9  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0080  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.82 
 
 		 182 aa  48.9  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16331  F0F1 ATP synthase subunit B'  25.55 
 
 		 153 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.320116  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2217  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  25.9 
 
 		 140 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.268099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  22.97 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  22.97 
 
 		 173 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  27.78 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  31.01 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.99 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0180  F0F1 ATP synthase subunit B  31.39 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2144  F0F1 ATP synthase subunit B  31.39 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  35.62 
 
 		 179 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  28.92 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  26.28 
 
 		 167 aa  47  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0601  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.5 
 
 		 141 aa  46.6  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1502  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  30.5 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.661479  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 		 175 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4332  F0F1 ATP synthase subunit B  24.44 
 
 		 166 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432219  normal  0.0619166 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  30.51 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  27.85 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2314  F0F1 ATP synthase subunit B  25.9 
 
 		 171 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4485  ATP synthase F0, B subunit  27.95 
 
 		 175 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.594987  normal  0.141672 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  29.66 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  33.33 
 
 		 163 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2385  ATP synthase F1 delta subunit  29.69 
 
 		 182 aa  46.2  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0133  ATP synthase F0, B subunit  29.63 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.746611  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0108  ATP synthase F0, B' subunit, putative  30 
 
 		 141 aa  46.2  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0172  ATP synthase F0, B subunit  27.03 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.173699  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06108  ATP synthase B chain  27.4 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  27.82 
 
 		 156 aa  45.4  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  26.79 
 
 		 156 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  26.09 
 
 		 165 aa  45.4  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  29.23 
 
 		 156 aa  45.4  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  24.84 
 
 		 172 aa  45.4  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  26.24 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  26.19 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1547  F0F1 ATP synthase subunit B'  23.36 
 
 		 153 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  28.46 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3288  F0F1 ATP synthase subunit B  28.31 
 
 		 156 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.160099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  27.01 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  31.73 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  28.81 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0251  F0F1 ATP synthase subunit B  31.94 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  28.81 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16561  F0F1 ATP synthase subunit B'  23.36 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16441  F0F1 ATP synthase subunit B'  24.09 
 
 		 153 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>