More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1765 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  100 
 
 
466 aa  946    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
531 aa  322  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  40.75 
 
 
526 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  41.06 
 
 
513 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  40.13 
 
 
463 aa  313  4.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
524 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  39.17 
 
 
501 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  39.65 
 
 
517 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.61 
 
 
515 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
515 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 
515 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  37.15 
 
 
499 aa  290  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
515 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  37.61 
 
 
517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
517 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 
519 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  38.26 
 
 
518 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  37.55 
 
 
523 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  38.18 
 
 
817 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  37.21 
 
 
505 aa  280  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  37.29 
 
 
505 aa  279  8e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  37.29 
 
 
505 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  37.29 
 
 
505 aa  279  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
517 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
517 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  37.91 
 
 
517 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.4 
 
 
509 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  38.14 
 
 
518 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  38.89 
 
 
469 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  38.68 
 
 
462 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
471 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
481 aa  260  4e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  37.09 
 
 
500 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  38.77 
 
 
506 aa  256  6e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
487 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
493 aa  253  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  37.75 
 
 
481 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 
459 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.409159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.37 
 
 
457 aa  248  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.097715  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
482 aa  247  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
494 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  34.07 
 
 
488 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
494 aa  244  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  34.22 
 
 
495 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  33.85 
 
 
494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  33.85 
 
 
488 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
494 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  33.85 
 
 
488 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  33.85 
 
 
488 aa  243  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  33.85 
 
 
494 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  34.07 
 
 
494 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
494 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
494 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3340  sensor histidine kinase  33.55 
 
 
495 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
480 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
493 aa  237  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 
462 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.12 
 
 
485 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.11 
 
 
475 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  35.29 
 
 
496 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  35.98 
 
 
481 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
484 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4230  sensor histidine kinase TctE  36.3 
 
 
460 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 
457 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3964  sensor histidine kinase  36.24 
 
 
460 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  34.39 
 
 
467 aa  230  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  35.81 
 
 
474 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  37.67 
 
 
467 aa  227  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 
469 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  36.17 
 
 
480 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  37.88 
 
 
460 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  35.15 
 
 
504 aa  224  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 
478 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2571  histidine kinase  34.26 
 
 
489 aa  223  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000673908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  34.75 
 
 
542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
461 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
560 aa  221  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
557 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
465 aa  220  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3229  histidine kinase  32.16 
 
 
557 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
501 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
499 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  35.76 
 
 
472 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0007  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
500 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
455 aa  216  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  35.84 
 
 
501 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2936  putative transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  35.61 
 
 
500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6107  two component sensor kinase  33.41 
 
 
467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  35.25 
 
 
439 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  35.22 
 
 
472 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0576  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
458 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.176736 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1365  histidine kinase  35.56 
 
 
463 aa  212  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4137  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
471 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0852151  hitchhiker  0.00000251535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>