More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1439 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1439  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  957    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0371695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1693  nucleotidyl transferase  25.87 
 
 		 481 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2952  nucleotidyl transferase  28.23 
 
 		 505 aa  179  9e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2004  nucleotidyl transferase  27.4 
 
 		 497 aa  156  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1423  nucleotidyl transferase  25.05 
 
 		 475 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2068  sugar transferase  27.8 
 
 		 566 aa  106  9e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  24.92 
 
 		 818 aa  88.6  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  25.76 
 
 		 854 aa  80.9  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  25.08 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  21.61 
 
 		 784 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  21.61 
 
 		 784 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  23.19 
 
 		 827 aa  77.4  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  21.61 
 
 		 784 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  21.61 
 
 		 784 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  21.61 
 
 		 784 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  23.55 
 
 		 400 aa  76.6  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  21.63 
 
 		 784 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  23.3 
 
 		 828 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  23.78 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  21.63 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  23.12 
 
 		 830 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  22.12 
 
 		 785 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  24.61 
 
 		 833 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  21.66 
 
 		 784 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  21.66 
 
 		 784 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  22.43 
 
 		 784 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.33 
 
 		 393 aa  71.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  20.57 
 
 		 816 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  22.56 
 
 		 835 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  23.17 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  24.69 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1016  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  21.88 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175531  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.05 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  35.45 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  23.12 
 
 		 821 aa  67  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.86 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.26 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 223 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  23.36 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  26.99 
 
 		 842 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  21.6 
 
 		 840 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  31.75 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  23.48 
 
 		 836 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  34.86 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  30.19 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  22.13 
 
 		 836 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  20.41 
 
 		 820 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  20.81 
 
 		 818 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1837  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  24.63 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.727944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  21.14 
 
 		 842 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  22.16 
 
 		 843 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  31.16 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  22.57 
 
 		 836 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  21.84 
 
 		 836 aa  60.1  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  21.41 
 
 		 835 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  19.81 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  23.78 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  19.75 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  35.51 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  28.3 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  21.43 
 
 		 347 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2883  nucleotidyl transferase  29.5 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000245528  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  22.16 
 
 		 843 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  31.19 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  26.85 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  23.99 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  22.4 
 
 		 842 aa  57.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  21.2 
 
 		 835 aa  57.4  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.7 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  21.6 
 
 		 820 aa  57  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  31.19 
 
 		 405 aa  57  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  35.45 
 
 		 236 aa  57  0.0000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  23.89 
 
 		 834 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  24.09 
 
 		 393 aa  56.6  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  30.56 
 
 		 223 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  23.39 
 
 		 837 aa  56.2  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  22.54 
 
 		 383 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0884  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 249 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000795934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1018  nucleotidyl transferase  34.48 
 
 		 228 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.352994  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  31.82 
 
 		 399 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  39.47 
 
 		 232 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  29.93 
 
 		 222 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 346 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  27.59 
 
 		 361 aa  55.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  30.91 
 
 		 240 aa  55.8  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  28.42 
 
 		 221 aa  55.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 		 222 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 243 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 		 223 aa  55.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 228 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  23.12 
 
 		 828 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  23.76 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  21.58 
 
 		 403 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  21.53 
 
 		 361 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  30.22 
 
 		 229 aa  54.7  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>