More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1693 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1693  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 481 aa  982    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2952  nucleotidyl transferase  56.62 
 
 		 505 aa  570  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1423  nucleotidyl transferase  42.09 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2004  nucleotidyl transferase  42.31 
 
 		 497 aa  343  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130422 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1439  hypothetical protein  25.87 
 
 		 487 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0371695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1016  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  22.74 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175531  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  23.55 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1837  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.66 
 
 		 440 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.727944  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.55 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  24.47 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  20.11 
 
 		 784 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  20.11 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  20.11 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  20.11 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.04 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  20.11 
 
 		 784 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  36.3 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  19.83 
 
 		 784 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.96 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  21.13 
 
 		 784 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  31.82 
 
 		 223 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  21.13 
 
 		 784 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 		 223 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  20.11 
 
 		 784 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  20.11 
 
 		 784 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  20.36 
 
 		 391 aa  72  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.55 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  20.87 
 
 		 785 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  23.56 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  35.45 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  21.02 
 
 		 830 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  23.84 
 
 		 818 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  31.82 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.41 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  38.18 
 
 		 240 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  27.52 
 
 		 227 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0511  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase-related protein  29.93 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.560778  normal  0.0591515 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  21.47 
 
 		 854 aa  68.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.04 
 
 		 357 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  34.23 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.19 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  37.27 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2147  nucleotidyl transferase  36.7 
 
 		 221 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  22.25 
 
 		 835 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0599  nucleotidyltransferase family protein  32.11 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  20.11 
 
 		 834 aa  67  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  19.69 
 
 		 833 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  28.76 
 
 		 355 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  31.36 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.64 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  29.06 
 
 		 222 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  25.5 
 
 		 227 aa  66.2  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  32.81 
 
 		 232 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 232 aa  66.6  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  26.85 
 
 		 228 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1828  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  21.02 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0493  nucleotidyl transferase  34.48 
 
 		 245 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.427783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  24.56 
 
 		 821 aa  65.1  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  28.79 
 
 		 240 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  23.81 
 
 		 810 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.66 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  26.27 
 
 		 348 aa  64.7  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0402  Nucleotidyl transferase  31.25 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  20.54 
 
 		 820 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.57 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  20.9 
 
 		 818 aa  63.5  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  31.19 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0387  Nucleotidyl transferase  32.73 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46780  nucleotidyl transferase  33.03 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.46 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.44 
 
 		 357 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4306  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.4 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 351 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  36.36 
 
 		 355 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.71 
 
 		 355 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  27.42 
 
 		 243 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.27 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.18 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.71 
 
 		 355 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.06 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  20.6 
 
 		 832 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1019  nucleotidyl transferase  31.19 
 
 		 229 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176753  normal  0.0292468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0867  nucleotidyl transferase  32.11 
 
 		 222 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0335423  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  23.49 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  22.05 
 
 		 349 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  30.28 
 
 		 222 aa  62.4  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  26.89 
 
 		 238 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1338  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.71 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.182375  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1403  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.71 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0784803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.51 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  25.66 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  27.41 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  23.46 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  32.46 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  32.46 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>