More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1423 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1423  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 475 aa  981    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2952  nucleotidyl transferase  41.16 
 
 		 505 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1693  nucleotidyl transferase  42.09 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2004  nucleotidyl transferase  39.33 
 
 		 497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130422 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1439  hypothetical protein  25.05 
 
 		 487 aa  144  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0371695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2068  sugar transferase  23.81 
 
 		 566 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  22.84 
 
 		 835 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1828  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  23.1 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1016  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  22.25 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175531  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  20.33 
 
 		 784 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  20.33 
 
 		 784 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  20.33 
 
 		 784 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  20.33 
 
 		 784 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  20.33 
 
 		 784 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  19.89 
 
 		 784 aa  72  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  20.33 
 
 		 784 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  21.02 
 
 		 833 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  20.33 
 
 		 784 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  22.73 
 
 		 835 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  30.53 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  20.5 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1365  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  22.47 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.746684 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  21.25 
 
 		 836 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35 
 
 		 359 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  21.45 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  19.87 
 
 		 784 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.41 
 
 		 355 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  20.34 
 
 		 835 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  23.68 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.08 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  21.82 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  20.87 
 
 		 785 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  19.67 
 
 		 830 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  20.49 
 
 		 818 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.57 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.08 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  19.88 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  21.02 
 
 		 836 aa  62.4  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  32.43 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.47 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.12 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  19.52 
 
 		 820 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  20.97 
 
 		 816 aa  61.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  20.5 
 
 		 836 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.42 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  21.79 
 
 		 810 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.03 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.57 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.63 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  36.36 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.32 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 396 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  19.58 
 
 		 854 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  20.24 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.77 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  23.05 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1338  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.99 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.182375  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1403  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.99 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0784803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  28.03 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  27.15 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.25 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.57 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.29 
 
 		 393 aa  57  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.67 
 
 		 355 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.87 
 
 		 355 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2758  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.8 
 
 		 295 aa  57  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  35.06 
 
 		 355 aa  57  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  27.94 
 
 		 393 aa  57  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.27 
 
 		 355 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.05 
 
 		 358 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  21.25 
 
 		 836 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  23.7 
 
 		 358 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  28.46 
 
 		 238 aa  56.6  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.91 
 
 		 357 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.95 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  25.56 
 
 		 367 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  22.59 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  18.98 
 
 		 833 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1391  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.26 
 
 		 312 aa  55.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918938 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.94 
 
 		 393 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 		 357 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 		 357 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  21.75 
 
 		 346 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.71 
 
 		 364 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  25.83 
 
 		 274 aa  55.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  28.33 
 
 		 399 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.93 
 
 		 355 aa  54.7  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  18.21 
 
 		 349 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.38 
 
 		 357 aa  54.3  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1837  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.95 
 
 		 440 aa  54.3  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.727944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  28.7 
 
 		 821 aa  54.3  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.46 
 
 		 292 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.180776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0586  nucleotidyl transferase  27.89 
 
 		 240 aa  53.9  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.82 
 
 		 292 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  19.24 
 
 		 820 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0774  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  35.23 
 
 		 292 aa  53.5  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 351 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2740  nucleotidyl transferase  26.03 
 
 		 240 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>