82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1016 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1016  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  100 
 
 		 458 aa  941    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175531  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1828  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  59.48 
 
 		 460 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1837  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  50.54 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.727944  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1365  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  45.75 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.746684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1693  nucleotidyl transferase  24.81 
 
 		 481 aa  97.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2952  nucleotidyl transferase  22.73 
 
 		 505 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1423  nucleotidyl transferase  22.5 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2004  nucleotidyl transferase  22.6 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130422 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  25.17 
 
 		 833 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1439  hypothetical protein  21.88 
 
 		 487 aa  69.7  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0371695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2068  sugar transferase  25.93 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  30.34 
 
 		 828 aa  56.6  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  22.12 
 
 		 854 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.17 
 
 		 784 aa  54.3  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  25.17 
 
 		 784 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  25.17 
 
 		 784 aa  53.9  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.17 
 
 		 784 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  25.17 
 
 		 784 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  29.25 
 
 		 830 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  24.5 
 
 		 784 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  30.34 
 
 		 842 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  24.5 
 
 		 784 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.91 
 
 		 842 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  22.26 
 
 		 784 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  33.8 
 
 		 816 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  36.71 
 
 		 810 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  23.24 
 
 		 381 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  33.67 
 
 		 405 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  21.07 
 
 		 784 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  22.07 
 
 		 784 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  24.86 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11536  hypothetical protein  28.46 
 
 		 221 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.315623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4116  hexapaptide repeat-containing transferase  46.27 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 842 aa  48.9  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  24.07 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  29.91 
 
 		 349 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  24.58 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  24 
 
 		 388 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.58 
 
 		 397 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  31.4 
 
 		 785 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4610  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase  25.15 
 
 		 391 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157776  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  19.87 
 
 		 818 aa  47.8  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  26.79 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0967  nucleotidyl transferase  27.05 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  32.91 
 
 		 776 aa  47.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  28.4 
 
 		 366 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  23.76 
 
 		 392 aa  46.6  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  29.7 
 
 		 361 aa  46.6  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  25.88 
 
 		 841 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  23.87 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  27.36 
 
 		 835 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1307  nucleotidyl transferase  29.89 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  29.7 
 
 		 361 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  25.31 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  25.31 
 
 		 388 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  21.74 
 
 		 832 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4450  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase  45 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0803  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase-like protein  43.33 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  32.1 
 
 		 827 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.18 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  30.14 
 
 		 832 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  29.49 
 
 		 843 aa  44.7  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  21.85 
 
 		 820 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  39.71 
 
 		 396 aa  44.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  28.71 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  23.04 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.34 
 
 		 392 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  22.76 
 
 		 397 aa  44.3  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  24.63 
 
 		 835 aa  44.3  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  23.53 
 
 		 376 aa  43.9  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  22.48 
 
 		 820 aa  43.9  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  23.17 
 
 		 389 aa  43.9  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  30.99 
 
 		 384 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  27.85 
 
 		 840 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  22.22 
 
 		 843 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2138  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase homolog  31.46 
 
 		 318 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.550477  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  23.2 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  34.29 
 
 		 384 aa  43.5  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  38.98 
 
 		 251 aa  43.5  0.008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  27.36 
 
 		 347 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 232 aa  43.5  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  24.16 
 
 		 399 aa  43.5  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>