90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1837 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1837  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  100 
 
 		 440 aa  899    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.727944  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1016  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  50.54 
 
 		 458 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000175531  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1828  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  48.04 
 
 		 460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1365  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  45.86 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.746684 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1693  nucleotidyl transferase  23.97 
 
 		 481 aa  86.7  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2068  sugar transferase  30.85 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  25.93 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2004  nucleotidyl transferase  23.74 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.130422 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2952  nucleotidyl transferase  21.79 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1439  hypothetical protein  25.1 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0371695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1423  nucleotidyl transferase  27.03 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  37.18 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  27.27 
 
 		 818 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  30.48 
 
 		 828 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  39.47 
 
 		 833 aa  56.6  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  33.72 
 
 		 776 aa  54.7  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  22.71 
 
 		 405 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  35.37 
 
 		 840 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  29.63 
 
 		 349 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  40 
 
 		 810 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  30.95 
 
 		 784 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.76 
 
 		 784 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.76 
 
 		 784 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.76 
 
 		 784 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  29.76 
 
 		 784 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.76 
 
 		 784 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.76 
 
 		 784 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  30.99 
 
 		 854 aa  49.7  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4116  hexapaptide repeat-containing transferase  27.73 
 
 		 432 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  32.81 
 
 		 821 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  35.71 
 
 		 785 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  29.57 
 
 		 348 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  29.76 
 
 		 784 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  33.77 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  32.35 
 
 		 843 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.29 
 
 		 784 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  22.19 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 830 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  22.19 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  34.29 
 
 		 784 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.33 
 
 		 842 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  34.15 
 
 		 842 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  26.04 
 
 		 827 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.63 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.17 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  32.04 
 
 		 835 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  27.35 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  25 
 
 		 832 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  37.14 
 
 		 830 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  35.9 
 
 		 827 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  23.66 
 
 		 828 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  40.3 
 
 		 832 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 392 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  40.3 
 
 		 832 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  25.52 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  25.52 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  31.03 
 
 		 347 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  32.5 
 
 		 816 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  31.3 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  29.7 
 
 		 388 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  30.3 
 
 		 381 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  29.89 
 
 		 842 aa  46.6  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  21.65 
 
 		 835 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  35.21 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.41 
 
 		 392 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  27.38 
 
 		 828 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  32.89 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4610  putative mannose-1-phosphate guanyltransferase  27.5 
 
 		 391 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157776  normal  0.623431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  32.47 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  30.14 
 
 		 818 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  28.18 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  30.68 
 
 		 820 aa  44.3  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  30.69 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  26.74 
 
 		 387 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  25.58 
 
 		 841 aa  43.9  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1989  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.19 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112346  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3162  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.84 
 
 		 312 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.84 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2754  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.84 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.84 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0791129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3140  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.84 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1851  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.84 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.530858  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0803  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase-like protein  40 
 
 		 466 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2009  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.87 
 
 		 292 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4450  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase  41.67 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  30.84 
 
 		 392 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.95 
 
 		 841 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 843 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  23.61 
 
 		 381 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>