225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02797 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  617  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  29.01 
 
 		 312 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  29.21 
 
 		 334 aa  96.7  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  29.24 
 
 		 286 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  29.93 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3173  hypothetical protein  29.2 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  0.1324 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  26.64 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  28.21 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  27.56 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  27.56 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  27.56 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  27.56 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  27.56 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  27.56 
 
 		 294 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  27.91 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  26.87 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1995  O-acetylserine/cysteine export protein  27.6 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  28.07 
 
 		 294 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.74 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.31 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4618  hypothetical protein  24.81 
 
 		 298 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  26.58 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01492  cysteine and O-acetyl-L-serine efflux system  25.98 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0660711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2113  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27.74 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.74 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01503  hypothetical protein  25.98 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0763437  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  24.92 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.29 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5553  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.27 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2147  O-acetylserine/cysteine export protein  25.54 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.758199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1631  O-acetylserine/cysteine export protein  25.71 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0826395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2125  O-acetylserine/cysteine export protein  25.62 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.290399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  23.83 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  25.62 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00179242  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.66 
 
 		 325 aa  56.2  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1741  O-acetylserine/cysteine export protein  25.62 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.457568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1653  O-acetylserine/cysteine export protein  28.71 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00898793  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1630  O-acetylserine/cysteine export protein  28.71 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1818  O-acetylserine/cysteine export protein  28.71 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.418802  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1689  O-acetylserine/cysteine export protein  29.56 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4057  hypothetical protein  25.97 
 
 		 299 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.365603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  26.96 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.5 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2612  hypothetical protein  27.74 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1622  O-acetylserine/cysteine export protein  28.22 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  26.96 
 
 		 294 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  26.96 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  24.2 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  26.24 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2483  hypothetical protein  27.74 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0867101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  26.56 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 291 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1122  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  23.84 
 
 		 296 aa  53.1  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  27.01 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 		 306 aa  53.1  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3809  integral membrane protein  25.33 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.770617  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  25 
 
 		 293 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  30.88 
 
 		 304 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.41 
 
 		 289 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1696  hypothetical protein  24.34 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.591039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0788  hypothetical protein  21.07 
 
 		 313 aa  52.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  21.25 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1406  hypothetical protein  24.42 
 
 		 312 aa  52.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0365604  normal  0.0466705 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  26.72 
 
 		 287 aa  52.4  0.000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.83 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  30.88 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  30.88 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  29.01 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  30.88 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.61 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2911  hypothetical protein  23.93 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.100063 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  27.07 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.61 
 
 		 283 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.37 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  27.46 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  25.88 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  31.11 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  23.21 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2376  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0860299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  26.98 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2691  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 299 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3324  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.37 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.82 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  24.08 
 
 		 303 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 289 aa  50.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  22.48 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.65 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  24.32 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>