More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00392 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00392  methionyl-tRNA formyltransferase  100 
 
 
278 aa  567  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00312  methionyl-tRNA formyltransferase  95.31 
 
 
256 aa  479  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1190  formyl transferase domain protein  24.82 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.738205  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1060  formyl transferase domain-containing protein  24.82 
 
 
288 aa  92  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.113837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0982  formyl transferase domain protein  25.54 
 
 
288 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  28.51 
 
 
307 aa  86.7  4e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5673  formyl transferase domain-containing protein  26.34 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5891  formyl transferase domain-containing protein  26.34 
 
 
284 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.487641  normal  0.0186917 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1300  methionyl-tRNA formyltransferase  27.84 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1275  methionyl-tRNA formyltransferase  27.84 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0782  methionyl-tRNA formyltransferase  29.6 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.606283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5456  formyl transferase domain-containing protein  24.1 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0931925 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0050  methionyl-tRNA formyltransferase  30.43 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.977686  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1040  methionyl-tRNA formyltransferase  29.67 
 
 
309 aa  78.6  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1761  formyl transferase domain protein  24.47 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.805724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0907  methionyl-tRNA formyltransferase  26.81 
 
 
310 aa  77.4  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000822843  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5625  formyl transferase domain-containing protein  28.22 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.165091 
 
 
-
 
NC_002978  WD0866  methionyl-tRNA formyltransferase  38.35 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1644  methionyl-tRNA formyltransferase  29.79 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0205  methionyl-tRNA formyltransferase  31.38 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0761  methionyl-tRNA formyltransferase  34.19 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194014 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0663  methionyl-tRNA formyltransferase  31.54 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2691  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  25.27 
 
 
664 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323806  normal  0.284705 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl409  methyonyl-tRNA formyltransferase  30.38 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0897  methionyl-tRNA formyltransferase  39.62 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0316  methionyl-tRNA formyltransferase  29.03 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1439  methionyl-tRNA formyltransferase  28.45 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0022  methionyl-tRNA formyltransferase  26.16 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3689  methionyl-tRNA formyltransferase  33.88 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2843  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  28.99 
 
 
668 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.322328  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2232  methionyl-tRNA formyltransferase  22.03 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2383  methionyl-tRNA formyltransferase  24.79 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596014  normal  0.0248257 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2926  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  30.08 
 
 
672 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3717  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00223065  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3607  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3625  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000492096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3914  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00718662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3880  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.43125e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4004  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3965  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1278  methionyl-tRNA formyltransferase  43.27 
 
 
314 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.289128 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2150  methionyl-tRNA formyltransferase  27.68 
 
 
323 aa  64.7  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3908  methionyl-tRNA formyltransferase  42.31 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2468  formyl transferase domain protein  37.5 
 
 
286 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0908762 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1395  methionyl-tRNA formyltransferase  25.84 
 
 
305 aa  63.9  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0568  methionyl-tRNA formyltransferase  22.68 
 
 
311 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000116959  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0319  formyl transferase domain-containing protein  31.06 
 
 
281 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.20234  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0236  methionyl-tRNA formyltransferase  30 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1161  formyl transferase domain protein  28.22 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0034  methionyl-tRNA formyltransferase  23.96 
 
 
329 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0590691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0094  methionyl-tRNA formyltransferase  26.47 
 
 
320 aa  63.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.922112  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2096  methionyl-tRNA formyltransferase  25.35 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.156857  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0090  methionyl-tRNA formyltransferase  25.35 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0186427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2540  formyl transferase domain-containing protein  38.27 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.05523  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0040  methionyl-tRNA formyltransferase  23.43 
 
 
317 aa  63.5  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0030  methionyl-tRNA formyltransferase  27.59 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2610  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  30.89 
 
 
667 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1833  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  30.89 
 
 
667 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1524  methionyl-tRNA formyltransferase  27.57 
 
 
320 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1727  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  30.89 
 
 
667 aa  63.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0517  formyltransferase, putative  28.12 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0521  putative formyltransferase  28.12 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3225  methionyl-tRNA formyltransferase  26.82 
 
 
313 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0188786 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0373  methionyl-tRNA formyltransferase  33.09 
 
 
308 aa  62.8  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0513  methionyl-tRNA formyltransferase  28.28 
 
 
319 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2518  methionyl-tRNA formyltransferase  31.69 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000107655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1176  methionyl-tRNA formyltransferase  28 
 
 
309 aa  62.8  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0139658  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf816  methionyl-tRNA formyltransferase  36.8 
 
 
285 aa  62.4  0.000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1591  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  24.55 
 
 
662 aa  62  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0432  putative formyltransferase  26.36 
 
 
289 aa  62.4  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1386  methionyl-tRNA formyltransferase  24.89 
 
 
315 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.442669  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0438  putative formyltransferase  26.01 
 
 
289 aa  62  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.273297 
 
 
-
 
NC_002936  DET1642  methionyl-tRNA formyltransferase  32.89 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0409  methionyl-tRNA formyltransferase  30.54 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0186  methionyl-tRNA formyltransferase  23.61 
 
 
308 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000823971 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10271  putative methionyl-tRNA formyltransferase  35.77 
 
 
346 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.360927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0393  methionyl-tRNA formyltransferase  30.54 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.691189  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6218  putative formyltransferase  24.38 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4226  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  34.69 
 
 
663 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1861  putative formyltransferase  24.38 
 
 
315 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2763  formyl transferase domain protein  37.04 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.535373  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2156  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  25 
 
 
660 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0787  methionyl-tRNA formyltransferase  34.11 
 
 
316 aa  60.8  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00021  methionyl-tRNA formyltransferase  23.83 
 
 
312 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0959  methionyl-tRNA formyltransferase  37.04 
 
 
328 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.500083  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2582  methionyl-tRNA formyltransferase  27.27 
 
 
328 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0097642  normal  0.0138205 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18350  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  24.56 
 
 
662 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208091  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1412  putative formyltransferase  25.11 
 
 
315 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.191298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2139  methionyl-tRNA formyltransferase  24.58 
 
 
361 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00931795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3398  methionyl-tRNA formyltransferase  23.37 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.726388  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1943  formyl transferase domain protein  37.18 
 
 
282 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4053  methionyl-tRNA formyltransferase  23.37 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2599  formyl transferase domain protein  31.9 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10281  putative methionyl-tRNA formyltransferase  36.59 
 
 
328 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.477504  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2647  hypothetical protein  24.05 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2517  hypothetical protein  25.1 
 
 
314 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4832  methionyl-tRNA formyltransferase  29.84 
 
 
306 aa  59.7  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000322713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0924  bifunctional UDP-glucuronic acid decarboxylase/UDP-4-amino-4-deoxy-L-arabinose formyltransferase  26.63 
 
 
660 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0037  methionyl-tRNA formyltransferase  26.03 
 
 
320 aa  59.3  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.553222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0196  methionyl-tRNA formyltransferase  23.96 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00869838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>