More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6495 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6495  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
206 aa  424  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  decreased coverage  0.00341928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6741  heat shock protein DnaJ domain protein  86.41 
 
 
206 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.450811  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3697  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  72.86 
 
 
208 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3231  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  65.11 
 
 
235 aa  287  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3426  heat shock protein DnaJ domain protein  63.87 
 
 
237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3555  heat shock protein DnaJ domain protein  64.83 
 
 
235 aa  285  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596429  normal  0.325089 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3428  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  53.85 
 
 
206 aa  211  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479104  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3068  heat shock protein DnaJ-like  47.89 
 
 
206 aa  190  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0319  heat shock protein DnaJ domain protein  48.06 
 
 
199 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300615 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0913  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  45.58 
 
 
209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2024  DnaJ domain-containing protein  44.19 
 
 
209 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0763655  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1947  DnaJ domain-containing protein  44.19 
 
 
209 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.673449  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2561  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  43.87 
 
 
211 aa  179  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4048  molecular chaperone DnaJ family  44.39 
 
 
223 aa  176  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.292979  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3592  heat shock protein DnaJ domain protein  43.33 
 
 
205 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.329646  normal  0.694233 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0536  heat shock protein DnaJ-like  46.05 
 
 
219 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.957898  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0539  heat shock protein DnaJ-like  45.07 
 
 
215 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0501  heat shock protein DnaJ domain protein  47.66 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3885  heat shock protein DnaJ domain protein  42.86 
 
 
205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0266628 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0290  heat shock protein DnaJ-like  45.54 
 
 
215 aa  171  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0496  heat shock protein DnaJ-like  46.63 
 
 
218 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0081  DnaJ domain-containing protein  38.79 
 
 
206 aa  164  9e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0401  heat shock protein DnaJ  45.93 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101457  normal  0.337808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7569  hypothetical protein  47.62 
 
 
189 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  44.5 
 
 
197 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.884874  normal  0.323014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2278  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.93 
 
 
204 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.52692  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1874  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  40.68 
 
 
208 aa  125  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.535727  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0714  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.28 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107685  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5215  heat shock protein DnaJ domain protein  35.38 
 
 
202 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.134163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1876  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  47.48 
 
 
134 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0205  heat shock protein DnaJ-like  35.06 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1713  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.76 
 
 
187 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5127  molecular chaperone DnaJ family  32.87 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2910  heat shock protein DnaJ-like  37.97 
 
 
196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294745  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1861  heat shock protein DnaJ-like  34.62 
 
 
210 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.921437  normal  0.0227918 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6075  heat shock protein DnaJ domain protein  30.73 
 
 
202 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0117  heat shock protein DnaJ domain protein  33.14 
 
 
176 aa  99.8  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.233042  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6015  heat shock protein DnaJ domain protein  32.98 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2332  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.36 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0679914  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3077  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32.26 
 
 
211 aa  94.7  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0646  heat shock protein DnaJ-like protein  36.16 
 
 
176 aa  94.4  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607248  normal  0.0426843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1978  DnaJ family molecular chaperone  31.55 
 
 
211 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0688  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.55 
 
 
211 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0645  heat shock protein DnaJ-like  31.25 
 
 
208 aa  87  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147986  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1202  heat shock protein DnaJ domain protein  31.25 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.370648  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5358  predicted protein  45.61 
 
 
294 aa  58.2  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653012  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2948  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.04 
 
 
176 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.133197  normal  0.0175295 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4473  chaperone protein DnaJ  44.44 
 
 
376 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.264667  normal  0.173386 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3573  chaperone protein DnaJ  40 
 
 
385 aa  52.8  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.856531  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1293  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
372 aa  52  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0649445  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0245  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
383 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  40.74 
 
 
386 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1019  heat shock protein DnaJ-like  25.27 
 
 
177 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2480  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.64 
 
 
317 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.129591  normal  0.116583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  41.18 
 
 
340 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3014  heat shock protein DnaJ domain protein  38.18 
 
 
458 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0982  chaperone DnaJ domain protein  38.18 
 
 
294 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  38.89 
 
 
373 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0786  chaperone DnaJ  41.18 
 
 
373 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1011  chaperone DnaJ domain protein  38.18 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4298  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
377 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  43.14 
 
 
298 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2579  heat shock protein DnaJ-like  42.59 
 
 
294 aa  49.7  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0083  chaperone protein DnaJ  43.14 
 
 
374 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  36.21 
 
 
375 aa  48.9  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
374 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1645  chaperone protein DnaJ  40.38 
 
 
383 aa  48.9  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0266103  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
374 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  47.06 
 
 
325 aa  48.5  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  34.43 
 
 
324 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1195  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
373 aa  48.9  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
374 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
375 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
377 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  38.6 
 
 
377 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
389 aa  48.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1988  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
379 aa  48.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.731806  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  35.09 
 
 
382 aa  48.1  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1748  heat shock protein DnaJ-like protein  29.11 
 
 
181 aa  48.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.405714  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.18 
 
 
324 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0624  heat shock protein DnaJ  40 
 
 
316 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.541417  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0675  heat shock protein  32.08 
 
 
276 aa  47.4  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.745295  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0506  heat shock protein DnaJ-like  39.22 
 
 
330 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366766  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  39.22 
 
 
311 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  34.55 
 
 
387 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  34.55 
 
 
387 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2117  chaperone protein DnaJ  41.18 
 
 
387 aa  47.4  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.0390426 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2209  chaperone DnaJ domain protein  39.22 
 
 
374 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.990749  hitchhiker  0.0052734 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1465  heat shock protein DnaJ domain protein  37.1 
 
 
213 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00965011  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  33.93 
 
 
330 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3102  curved DNA-binding protein  38.46 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0177095  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  36.21 
 
 
375 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2700  chaperone DnaJ domain protein  38.46 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.062215  hitchhiker  0.0000000117807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  36.36 
 
 
297 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.18 
 
 
297 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1520  heat shock protein DnaJ domain protein  39.22 
 
 
228 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  37.04 
 
 
377 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  37.04 
 
 
381 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.22 
 
 
315 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  37.25 
 
 
337 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>