157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5579 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3441  Rieske (2Fe-2S) domain protein  69.26 
 
 
599 aa  805    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6175  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.53 
 
 
593 aa  888    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659991  hitchhiker  0.00257919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
594 aa  1181    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.24 
 
 
604 aa  431  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.13 
 
 
116 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.13 
 
 
116 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  32.08 
 
 
116 aa  63.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.46 
 
 
101 aa  62.4  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
123 aa  61.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  32.35 
 
 
118 aa  60.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.05 
 
 
506 aa  60.5  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.51 
 
 
289 aa  60.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.26 
 
 
506 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  36.47 
 
 
649 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.84 
 
 
116 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.23 
 
 
504 aa  57.8  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.67 
 
 
100 aa  57.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.58 
 
 
112 aa  57.4  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.23 
 
 
506 aa  57.4  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  40 
 
 
315 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  36.59 
 
 
291 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.65 
 
 
100 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4269  vanillate monooxygenase  39.33 
 
 
351 aa  55.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.846398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 
107 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.93 
 
 
99 aa  55.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.33 
 
 
521 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1452  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  36.78 
 
 
112 aa  53.9  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00226382  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  40.43 
 
 
559 aa  53.9  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
100 aa  53.5  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.69 
 
 
106 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  32.43 
 
 
103 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  32.88 
 
 
98 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  41.03 
 
 
656 aa  52.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.33 
 
 
286 aa  52.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  33.78 
 
 
102 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.04 
 
 
101 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.96 
 
 
114 aa  52.4  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 
509 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4823  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  40 
 
 
285 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
322 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.33 
 
 
117 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 
285 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  31.71 
 
 
289 aa  50.8  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  39.19 
 
 
356 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.35 
 
 
289 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  29.47 
 
 
100 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.27 
 
 
270 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36 
 
 
118 aa  49.7  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.82 
 
 
171 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.84 
 
 
125 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  37.66 
 
 
334 aa  49.7  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3123  Rieske (2Fe-2S) protein  27.71 
 
 
349 aa  49.3  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.164048 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  41.38 
 
 
521 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
309 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  29.35 
 
 
289 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.02 
 
 
111 aa  49.7  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
105 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  31.43 
 
 
289 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.95 
 
 
110 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5628  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  38.14 
 
 
351 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.834519  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.33 
 
 
114 aa  49.7  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.37 
 
 
104 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 
527 aa  48.9  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  33.33 
 
 
599 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.63 
 
 
506 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  29.47 
 
 
99 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.94 
 
 
358 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.36 
 
 
105 aa  47.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  36.59 
 
 
338 aa  47.8  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.86 
 
 
102 aa  47.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  53.66 
 
 
126 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  35.71 
 
 
351 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26520  predicted protein  36.67 
 
 
150 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  46.15 
 
 
388 aa  47.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.52 
 
 
118 aa  47.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.57 
 
 
344 aa  47.4  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.270675  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.36 
 
 
114 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  39.06 
 
 
106 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0336  Rieske (2Fe-2S) protein  47.62 
 
 
370 aa  46.6  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  33.72 
 
 
311 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  35.37 
 
 
122 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.06 
 
 
354 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  37.08 
 
 
367 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  32 
 
 
113 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  35.23 
 
 
347 aa  47  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4349  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.78 
 
 
516 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.504096  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03296  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 
162 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0596852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  32.14 
 
 
102 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.62 
 
 
518 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  33.73 
 
 
125 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.26 
 
 
120 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  34.15 
 
 
350 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 
100 aa  45.8  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.31 
 
 
270 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4593  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.87 
 
 
353 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.79 
 
 
301 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  41.79 
 
 
296 aa  46.2  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.42 
 
 
506 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.18 
 
 
294 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1327  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.33 
 
 
106 aa  46.2  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0198751  normal  0.195781 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>